Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRB3

CHST12, Carbohydrate sulfotransferase 12, humanhuman

Predictions only

Length 414 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHST12Q9NRB3 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CHST12Q9NRB3 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CHST12Q9NRB3 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CHST12Q9NRB3 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CHST12Q9NRB3 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CHST12Q9NRB3 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CHST12Q9NRB3 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
CHST12Q9NRB3 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CHST12Q9NRB3 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CHST12Q9NRB3 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CHST12Q9NRB3 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CHST12Q9NRB3 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CHST12Q9NRB3 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CHST12Q9NRB3 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CHST12Q9NRB3 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CHST12Q9NRB3 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CHST12Q9NRB3 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CHST12Q9NRB3 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CHST12Q9NRB3 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CHST12Q9NRB3 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CHST12Q9NRB3 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CHST12Q9NRB3 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CHST12Q9NRB3 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CHST12Q9NRB3 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CHST12Q9NRB3 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CHST12Q9NRB3 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CHST12Q9NRB3 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CHST12Q9NRB3 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CHST12Q9NRB3 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CHST12Q9NRB3 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CHST12Q9NRB3 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CHST12Q9NRB3 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CHST12Q9NRB3 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CHST12Q9NRB3 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CHST12Q9NRB3 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CHST12Q9NRB3 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CHST12Q9NRB3 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CHST12Q9NRB3 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CHST12Q9NRB3 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CHST12Q9NRB3 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CHST12Q9NRB3 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CHST12Q9NRB3 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CHST12Q9NRB3 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CHST12Q9NRB3 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CHST12Q9NRB3 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CHST12Q9NRB3 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CHST12Q9NRB3 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CHST12Q9NRB3 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CHST12Q9NRB3 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CHST12Q9NRB3 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CHST12Q9NRB3 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CHST12Q9NRB3 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CHST12Q9NRB3 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CHST12Q9NRB3 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CHST12Q9NRB3 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
CHST12Q9NRB3 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CHST12Q9NRB3 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CHST12Q9NRB3 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CHST12Q9NRB3 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CHST12Q9NRB3 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CHST12Q9NRB3 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CHST12Q9NRB3 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CHST12Q9NRB3 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
CHST12Q9NRB3 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
CHST12Q9NRB3 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CHST12Q9NRB3 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
CHST12Q9NRB3 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CHST12Q9NRB3 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CHST12Q9NRB3 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CHST12Q9NRB3 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CHST12Q9NRB3 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CHST12Q9NRB3 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CHST12Q9NRB3 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CHST12Q9NRB3 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CHST12Q9NRB3 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CHST12Q9NRB3 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CHST12Q9NRB3 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
CHST12Q9NRB3 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
CHST12Q9NRB3 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CHST12Q9NRB3 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CHST12Q9NRB3 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
CHST12Q9NRB3 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CHST12Q9NRB3 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CHST12Q9NRB3 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CHST12Q9NRB3 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CHST12Q9NRB3 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CHST12Q9NRB3 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CHST12Q9NRB3 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CHST12Q9NRB3 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CHST12Q9NRB3 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CHST12Q9NRB3 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CHST12Q9NRB3 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CHST12Q9NRB3 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CHST12Q9NRB3 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CHST12Q9NRB3 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CHST12Q9NRB3 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CHST12Q9NRB3 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CHST12Q9NRB3 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CHST12Q9NRB3 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CHST12Q9NRB3 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms