Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR00

C8orf4, Protein C8orf4, humanhuman

Predictions only

Length 106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C8orf4Q9NR00 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
C8orf4Q9NR00 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
C8orf4Q9NR00 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
C8orf4Q9NR00 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
C8orf4Q9NR00 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
C8orf4Q9NR00 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
C8orf4Q9NR00 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
C8orf4Q9NR00 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
C8orf4Q9NR00 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
C8orf4Q9NR00 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
C8orf4Q9NR00 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
C8orf4Q9NR00 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
C8orf4Q9NR00 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
C8orf4Q9NR00 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
C8orf4Q9NR00 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
C8orf4Q9NR00 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
C8orf4Q9NR00 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
C8orf4Q9NR00 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
C8orf4Q9NR00 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
C8orf4Q9NR00 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
C8orf4Q9NR00 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
C8orf4Q9NR00 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
C8orf4Q9NR00 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
C8orf4Q9NR00 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
C8orf4Q9NR00 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
C8orf4Q9NR00 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
C8orf4Q9NR00 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
C8orf4Q9NR00 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
C8orf4Q9NR00 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
C8orf4Q9NR00 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
C8orf4Q9NR00 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
C8orf4Q9NR00 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
C8orf4Q9NR00 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
C8orf4Q9NR00 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
C8orf4Q9NR00 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
C8orf4Q9NR00 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
C8orf4Q9NR00 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
C8orf4Q9NR00 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
C8orf4Q9NR00 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
C8orf4Q9NR00 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
C8orf4Q9NR00 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
C8orf4Q9NR00 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
C8orf4Q9NR00 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
C8orf4Q9NR00 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
C8orf4Q9NR00 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
C8orf4Q9NR00 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
C8orf4Q9NR00 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
C8orf4Q9NR00 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
C8orf4Q9NR00 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
C8orf4Q9NR00 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
C8orf4Q9NR00 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
C8orf4Q9NR00 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
C8orf4Q9NR00 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
C8orf4Q9NR00 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
C8orf4Q9NR00 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
C8orf4Q9NR00 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
C8orf4Q9NR00 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
C8orf4Q9NR00 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
C8orf4Q9NR00 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
C8orf4Q9NR00 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
C8orf4Q9NR00 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
C8orf4Q9NR00 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
C8orf4Q9NR00 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
C8orf4Q9NR00 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
C8orf4Q9NR00 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
C8orf4Q9NR00 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
C8orf4Q9NR00 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
C8orf4Q9NR00 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
C8orf4Q9NR00 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
C8orf4Q9NR00 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
C8orf4Q9NR00 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
C8orf4Q9NR00 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
C8orf4Q9NR00 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
C8orf4Q9NR00 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
C8orf4Q9NR00 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
C8orf4Q9NR00 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
C8orf4Q9NR00 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
C8orf4Q9NR00 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
C8orf4Q9NR00 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
C8orf4Q9NR00 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
C8orf4Q9NR00 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
C8orf4Q9NR00 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
C8orf4Q9NR00 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
C8orf4Q9NR00 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
C8orf4Q9NR00 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
C8orf4Q9NR00 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
C8orf4Q9NR00 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
C8orf4Q9NR00 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
C8orf4Q9NR00 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
C8orf4Q9NR00 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
C8orf4Q9NR00 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
C8orf4Q9NR00 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
C8orf4Q9NR00 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
C8orf4Q9NR00 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
C8orf4Q9NR00 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
C8orf4Q9NR00 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
C8orf4Q9NR00 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
C8orf4Q9NR00 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
C8orf4Q9NR00 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
C8orf4Q9NR00 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms