Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQX3

GPHN, Gephyrin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPHNQ9NQX3 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GPHNQ9NQX3 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GPHNQ9NQX3 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GPHNQ9NQX3 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GPHNQ9NQX3 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GPHNQ9NQX3 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GPHNQ9NQX3 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
GPHNQ9NQX3 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GPHNQ9NQX3 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GPHNQ9NQX3 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GPHNQ9NQX3 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GPHNQ9NQX3 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GPHNQ9NQX3 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GPHNQ9NQX3 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GPHNQ9NQX3 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GPHNQ9NQX3 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GPHNQ9NQX3 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GPHNQ9NQX3 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GPHNQ9NQX3 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GPHNQ9NQX3 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GPHNQ9NQX3 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GPHNQ9NQX3 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GPHNQ9NQX3 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GPHNQ9NQX3 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
GPHNQ9NQX3 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GPHNQ9NQX3 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GPHNQ9NQX3 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GPHNQ9NQX3 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GPHNQ9NQX3 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
GPHNQ9NQX3 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
GPHNQ9NQX3 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
GPHNQ9NQX3 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
GPHNQ9NQX3 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
GPHNQ9NQX3 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GPHNQ9NQX3 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GPHNQ9NQX3 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GPHNQ9NQX3 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GPHNQ9NQX3 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GPHNQ9NQX3 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GPHNQ9NQX3 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GPHNQ9NQX3 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GPHNQ9NQX3 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GPHNQ9NQX3 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GPHNQ9NQX3 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GPHNQ9NQX3 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
GPHNQ9NQX3 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GPHNQ9NQX3 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GPHNQ9NQX3 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GPHNQ9NQX3 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GPHNQ9NQX3 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GPHNQ9NQX3 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GPHNQ9NQX3 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GPHNQ9NQX3 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GPHNQ9NQX3 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GPHNQ9NQX3 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GPHNQ9NQX3 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GPHNQ9NQX3 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GPHNQ9NQX3 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GPHNQ9NQX3 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
GPHNQ9NQX3 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
GPHNQ9NQX3 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GPHNQ9NQX3 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GPHNQ9NQX3 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GPHNQ9NQX3 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GPHNQ9NQX3 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
GPHNQ9NQX3 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GPHNQ9NQX3 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GPHNQ9NQX3 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GPHNQ9NQX3 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GPHNQ9NQX3 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GPHNQ9NQX3 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GPHNQ9NQX3 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GPHNQ9NQX3 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GPHNQ9NQX3 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GPHNQ9NQX3 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GPHNQ9NQX3 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GPHNQ9NQX3 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GPHNQ9NQX3 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GPHNQ9NQX3 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GPHNQ9NQX3 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GPHNQ9NQX3 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GPHNQ9NQX3 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GPHNQ9NQX3 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GPHNQ9NQX3 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GPHNQ9NQX3 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GPHNQ9NQX3 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
GPHNQ9NQX3 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GPHNQ9NQX3 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
GPHNQ9NQX3 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GPHNQ9NQX3 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GPHNQ9NQX3 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GPHNQ9NQX3 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GPHNQ9NQX3 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GPHNQ9NQX3 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GPHNQ9NQX3 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GPHNQ9NQX3 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GPHNQ9NQX3 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GPHNQ9NQX3 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GPHNQ9NQX3 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GPHNQ9NQX3 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms