Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCU9

BRMS1, Breast cancer metastasis-suppressor 1, humanhuman

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRMS1Q9HCU9 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
BRMS1Q9HCU9 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
BRMS1Q9HCU9 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
BRMS1Q9HCU9 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
BRMS1Q9HCU9 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
BRMS1Q9HCU9 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
BRMS1Q9HCU9 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
BRMS1Q9HCU9 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
BRMS1Q9HCU9 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
BRMS1Q9HCU9 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
BRMS1Q9HCU9 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
BRMS1Q9HCU9 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
BRMS1Q9HCU9 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
BRMS1Q9HCU9 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
BRMS1Q9HCU9 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
BRMS1Q9HCU9 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
BRMS1Q9HCU9 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
BRMS1Q9HCU9 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
BRMS1Q9HCU9 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
BRMS1Q9HCU9 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
BRMS1Q9HCU9 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
BRMS1Q9HCU9 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
BRMS1Q9HCU9 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
BRMS1Q9HCU9 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
BRMS1Q9HCU9 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
BRMS1Q9HCU9 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
BRMS1Q9HCU9 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
BRMS1Q9HCU9 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
BRMS1Q9HCU9 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
BRMS1Q9HCU9 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
BRMS1Q9HCU9 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
BRMS1Q9HCU9 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BRMS1Q9HCU9 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
BRMS1Q9HCU9 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BRMS1Q9HCU9 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
BRMS1Q9HCU9 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
BRMS1Q9HCU9 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BRMS1Q9HCU9 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BRMS1Q9HCU9 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BRMS1Q9HCU9 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BRMS1Q9HCU9 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
BRMS1Q9HCU9 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BRMS1Q9HCU9 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
BRMS1Q9HCU9 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BRMS1Q9HCU9 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
BRMS1Q9HCU9 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BRMS1Q9HCU9 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BRMS1Q9HCU9 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
BRMS1Q9HCU9 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BRMS1Q9HCU9 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BRMS1Q9HCU9 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
BRMS1Q9HCU9 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BRMS1Q9HCU9 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BRMS1Q9HCU9 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BRMS1Q9HCU9 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BRMS1Q9HCU9 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BRMS1Q9HCU9 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BRMS1Q9HCU9 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BRMS1Q9HCU9 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BRMS1Q9HCU9 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
BRMS1Q9HCU9 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BRMS1Q9HCU9 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
BRMS1Q9HCU9 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
BRMS1Q9HCU9 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
BRMS1Q9HCU9 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
BRMS1Q9HCU9 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
BRMS1Q9HCU9 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
BRMS1Q9HCU9 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BRMS1Q9HCU9 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BRMS1Q9HCU9 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
BRMS1Q9HCU9 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
BRMS1Q9HCU9 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
BRMS1Q9HCU9 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
BRMS1Q9HCU9 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BRMS1Q9HCU9 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BRMS1Q9HCU9 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BRMS1Q9HCU9 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
BRMS1Q9HCU9 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
BRMS1Q9HCU9 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
BRMS1Q9HCU9 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
BRMS1Q9HCU9 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
BRMS1Q9HCU9 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
BRMS1Q9HCU9 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
BRMS1Q9HCU9 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
BRMS1Q9HCU9 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
BRMS1Q9HCU9 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
BRMS1Q9HCU9 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
BRMS1Q9HCU9 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
BRMS1Q9HCU9 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
BRMS1Q9HCU9 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
BRMS1Q9HCU9 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
BRMS1Q9HCU9 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
BRMS1Q9HCU9 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
BRMS1Q9HCU9 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
BRMS1Q9HCU9 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
BRMS1Q9HCU9 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
BRMS1Q9HCU9 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
BRMS1Q9HCU9 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
BRMS1Q9HCU9 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
BRMS1Q9HCU9 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms