Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7Z3

NRDE2, Protein NRDE2 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRDE2Q9H7Z3 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
NRDE2Q9H7Z3 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
NRDE2Q9H7Z3 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
NRDE2Q9H7Z3 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
NRDE2Q9H7Z3 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
NRDE2Q9H7Z3 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
NRDE2Q9H7Z3 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
NRDE2Q9H7Z3 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
NRDE2Q9H7Z3 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
NRDE2Q9H7Z3 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
NRDE2Q9H7Z3 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
NRDE2Q9H7Z3 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
NRDE2Q9H7Z3 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC20.76■□□□□ 0.91
NRDE2Q9H7Z3 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
NRDE2Q9H7Z3 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
NRDE2Q9H7Z3 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
NRDE2Q9H7Z3 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
NRDE2Q9H7Z3 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
NRDE2Q9H7Z3 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
NRDE2Q9H7Z3 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
NRDE2Q9H7Z3 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
NRDE2Q9H7Z3 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
NRDE2Q9H7Z3 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
NRDE2Q9H7Z3 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
NRDE2Q9H7Z3 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
NRDE2Q9H7Z3 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
NRDE2Q9H7Z3 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
NRDE2Q9H7Z3 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
NRDE2Q9H7Z3 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
NRDE2Q9H7Z3 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
NRDE2Q9H7Z3 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
NRDE2Q9H7Z3 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
NRDE2Q9H7Z3 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
NRDE2Q9H7Z3 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
NRDE2Q9H7Z3 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
NRDE2Q9H7Z3 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
NRDE2Q9H7Z3 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
NRDE2Q9H7Z3 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
NRDE2Q9H7Z3 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
NRDE2Q9H7Z3 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
NRDE2Q9H7Z3 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
NRDE2Q9H7Z3 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
NRDE2Q9H7Z3 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
NRDE2Q9H7Z3 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
NRDE2Q9H7Z3 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
NRDE2Q9H7Z3 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
NRDE2Q9H7Z3 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
NRDE2Q9H7Z3 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
NRDE2Q9H7Z3 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
NRDE2Q9H7Z3 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
NRDE2Q9H7Z3 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
NRDE2Q9H7Z3 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
NRDE2Q9H7Z3 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
NRDE2Q9H7Z3 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
NRDE2Q9H7Z3 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
NRDE2Q9H7Z3 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
NRDE2Q9H7Z3 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
NRDE2Q9H7Z3 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
NRDE2Q9H7Z3 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
NRDE2Q9H7Z3 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
NRDE2Q9H7Z3 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
NRDE2Q9H7Z3 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
NRDE2Q9H7Z3 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
NRDE2Q9H7Z3 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
NRDE2Q9H7Z3 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
NRDE2Q9H7Z3 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
NRDE2Q9H7Z3 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
NRDE2Q9H7Z3 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
NRDE2Q9H7Z3 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
NRDE2Q9H7Z3 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
NRDE2Q9H7Z3 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
NRDE2Q9H7Z3 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
NRDE2Q9H7Z3 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
NRDE2Q9H7Z3 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
NRDE2Q9H7Z3 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
NRDE2Q9H7Z3 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
NRDE2Q9H7Z3 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
NRDE2Q9H7Z3 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
NRDE2Q9H7Z3 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
NRDE2Q9H7Z3 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
NRDE2Q9H7Z3 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
NRDE2Q9H7Z3 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
NRDE2Q9H7Z3 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
NRDE2Q9H7Z3 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
NRDE2Q9H7Z3 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
NRDE2Q9H7Z3 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
NRDE2Q9H7Z3 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
NRDE2Q9H7Z3 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
NRDE2Q9H7Z3 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
NRDE2Q9H7Z3 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
NRDE2Q9H7Z3 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC20.72■□□□□ 0.91
NRDE2Q9H7Z3 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
NRDE2Q9H7Z3 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
NRDE2Q9H7Z3 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
NRDE2Q9H7Z3 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
NRDE2Q9H7Z3 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
NRDE2Q9H7Z3 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
NRDE2Q9H7Z3 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
NRDE2Q9H7Z3 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
NRDE2Q9H7Z3 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms