Protein–RNA interactions for Protein: Q9H204

MED28, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 28, humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED28Q9H204 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MED28Q9H204 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MED28Q9H204 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MED28Q9H204 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MED28Q9H204 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MED28Q9H204 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MED28Q9H204 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MED28Q9H204 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MED28Q9H204 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MED28Q9H204 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MED28Q9H204 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MED28Q9H204 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MED28Q9H204 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MED28Q9H204 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MED28Q9H204 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MED28Q9H204 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MED28Q9H204 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MED28Q9H204 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MED28Q9H204 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
MED28Q9H204 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MED28Q9H204 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MED28Q9H204 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MED28Q9H204 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MED28Q9H204 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MED28Q9H204 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MED28Q9H204 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MED28Q9H204 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MED28Q9H204 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MED28Q9H204 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MED28Q9H204 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MED28Q9H204 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
MED28Q9H204 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MED28Q9H204 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MED28Q9H204 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MED28Q9H204 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MED28Q9H204 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MED28Q9H204 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MED28Q9H204 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MED28Q9H204 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MED28Q9H204 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MED28Q9H204 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MED28Q9H204 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MED28Q9H204 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MED28Q9H204 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MED28Q9H204 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MED28Q9H204 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MED28Q9H204 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MED28Q9H204 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MED28Q9H204 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MED28Q9H204 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MED28Q9H204 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MED28Q9H204 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MED28Q9H204 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MED28Q9H204 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MED28Q9H204 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MED28Q9H204 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MED28Q9H204 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MED28Q9H204 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MED28Q9H204 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MED28Q9H204 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
MED28Q9H204 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MED28Q9H204 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MED28Q9H204 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
MED28Q9H204 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MED28Q9H204 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MED28Q9H204 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MED28Q9H204 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MED28Q9H204 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MED28Q9H204 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MED28Q9H204 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MED28Q9H204 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MED28Q9H204 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MED28Q9H204 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MED28Q9H204 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MED28Q9H204 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MED28Q9H204 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MED28Q9H204 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MED28Q9H204 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MED28Q9H204 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MED28Q9H204 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MED28Q9H204 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MED28Q9H204 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MED28Q9H204 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MED28Q9H204 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MED28Q9H204 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MED28Q9H204 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MED28Q9H204 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MED28Q9H204 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MED28Q9H204 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MED28Q9H204 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MED28Q9H204 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MED28Q9H204 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MED28Q9H204 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MED28Q9H204 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MED28Q9H204 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
MED28Q9H204 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MED28Q9H204 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MED28Q9H204 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MED28Q9H204 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MED28Q9H204 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms