Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZC1

CELF4, CUGBP Elav-like family member 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CELF4Q9BZC1 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CELF4Q9BZC1 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CELF4Q9BZC1 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CELF4Q9BZC1 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CELF4Q9BZC1 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CELF4Q9BZC1 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CELF4Q9BZC1 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CELF4Q9BZC1 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CELF4Q9BZC1 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
CELF4Q9BZC1 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CELF4Q9BZC1 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CELF4Q9BZC1 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CELF4Q9BZC1 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CELF4Q9BZC1 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CELF4Q9BZC1 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CELF4Q9BZC1 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CELF4Q9BZC1 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
CELF4Q9BZC1 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CELF4Q9BZC1 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
CELF4Q9BZC1 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CELF4Q9BZC1 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CELF4Q9BZC1 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CELF4Q9BZC1 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CELF4Q9BZC1 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CELF4Q9BZC1 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CELF4Q9BZC1 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CELF4Q9BZC1 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CELF4Q9BZC1 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CELF4Q9BZC1 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CELF4Q9BZC1 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CELF4Q9BZC1 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
CELF4Q9BZC1 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CELF4Q9BZC1 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CELF4Q9BZC1 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CELF4Q9BZC1 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CELF4Q9BZC1 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CELF4Q9BZC1 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CELF4Q9BZC1 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
CELF4Q9BZC1 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CELF4Q9BZC1 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CELF4Q9BZC1 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CELF4Q9BZC1 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CELF4Q9BZC1 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CELF4Q9BZC1 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CELF4Q9BZC1 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CELF4Q9BZC1 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CELF4Q9BZC1 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CELF4Q9BZC1 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CELF4Q9BZC1 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CELF4Q9BZC1 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CELF4Q9BZC1 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CELF4Q9BZC1 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CELF4Q9BZC1 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CELF4Q9BZC1 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CELF4Q9BZC1 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CELF4Q9BZC1 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CELF4Q9BZC1 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CELF4Q9BZC1 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CELF4Q9BZC1 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CELF4Q9BZC1 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CELF4Q9BZC1 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CELF4Q9BZC1 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CELF4Q9BZC1 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CELF4Q9BZC1 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CELF4Q9BZC1 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CELF4Q9BZC1 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CELF4Q9BZC1 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CELF4Q9BZC1 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CELF4Q9BZC1 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
CELF4Q9BZC1 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CELF4Q9BZC1 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CELF4Q9BZC1 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
CELF4Q9BZC1 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
CELF4Q9BZC1 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CELF4Q9BZC1 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
CELF4Q9BZC1 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
CELF4Q9BZC1 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CELF4Q9BZC1 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CELF4Q9BZC1 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CELF4Q9BZC1 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CELF4Q9BZC1 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CELF4Q9BZC1 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CELF4Q9BZC1 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CELF4Q9BZC1 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CELF4Q9BZC1 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CELF4Q9BZC1 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CELF4Q9BZC1 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CELF4Q9BZC1 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CELF4Q9BZC1 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CELF4Q9BZC1 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CELF4Q9BZC1 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CELF4Q9BZC1 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CELF4Q9BZC1 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CELF4Q9BZC1 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CELF4Q9BZC1 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CELF4Q9BZC1 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CELF4Q9BZC1 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CELF4Q9BZC1 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
CELF4Q9BZC1 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC21.27■■□□□ 1
CELF4Q9BZC1 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60 ms