Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY66

KDM5D, Lysine-specific demethylase 5D, humanhuman

Predictions only

Length 1,539 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5DQ9BY66 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
KDM5DQ9BY66 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
KDM5DQ9BY66 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
KDM5DQ9BY66 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
KDM5DQ9BY66 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
KDM5DQ9BY66 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
KDM5DQ9BY66 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
KDM5DQ9BY66 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
KDM5DQ9BY66 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
KDM5DQ9BY66 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
KDM5DQ9BY66 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
KDM5DQ9BY66 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
KDM5DQ9BY66 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
KDM5DQ9BY66 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
KDM5DQ9BY66 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
KDM5DQ9BY66 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
KDM5DQ9BY66 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
KDM5DQ9BY66 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
KDM5DQ9BY66 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
KDM5DQ9BY66 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC28.41■■■□□ 2.14
KDM5DQ9BY66 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
KDM5DQ9BY66 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
KDM5DQ9BY66 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
KDM5DQ9BY66 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
KDM5DQ9BY66 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
KDM5DQ9BY66 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
KDM5DQ9BY66 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
KDM5DQ9BY66 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
KDM5DQ9BY66 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
KDM5DQ9BY66 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
KDM5DQ9BY66 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
KDM5DQ9BY66 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
KDM5DQ9BY66 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
KDM5DQ9BY66 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
KDM5DQ9BY66 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
KDM5DQ9BY66 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
KDM5DQ9BY66 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
KDM5DQ9BY66 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
KDM5DQ9BY66 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
KDM5DQ9BY66 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
KDM5DQ9BY66 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
KDM5DQ9BY66 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
KDM5DQ9BY66 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
KDM5DQ9BY66 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
KDM5DQ9BY66 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
KDM5DQ9BY66 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
KDM5DQ9BY66 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
KDM5DQ9BY66 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
KDM5DQ9BY66 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC28.39■■■□□ 2.14
KDM5DQ9BY66 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
KDM5DQ9BY66 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.13
KDM5DQ9BY66 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
KDM5DQ9BY66 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
KDM5DQ9BY66 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
KDM5DQ9BY66 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC28.38■■■□□ 2.13
KDM5DQ9BY66 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
KDM5DQ9BY66 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
KDM5DQ9BY66 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC28.38■■■□□ 2.13
KDM5DQ9BY66 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
KDM5DQ9BY66 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
KDM5DQ9BY66 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
KDM5DQ9BY66 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
KDM5DQ9BY66 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
KDM5DQ9BY66 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
KDM5DQ9BY66 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
KDM5DQ9BY66 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
KDM5DQ9BY66 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
KDM5DQ9BY66 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
KDM5DQ9BY66 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC28.38■■■□□ 2.13
KDM5DQ9BY66 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
KDM5DQ9BY66 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
KDM5DQ9BY66 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
KDM5DQ9BY66 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC28.38■■■□□ 2.13
KDM5DQ9BY66 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
KDM5DQ9BY66 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
KDM5DQ9BY66 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
KDM5DQ9BY66 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
KDM5DQ9BY66 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
KDM5DQ9BY66 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
KDM5DQ9BY66 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
KDM5DQ9BY66 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
KDM5DQ9BY66 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
KDM5DQ9BY66 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
KDM5DQ9BY66 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
KDM5DQ9BY66 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
KDM5DQ9BY66 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
KDM5DQ9BY66 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
KDM5DQ9BY66 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
KDM5DQ9BY66 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
KDM5DQ9BY66 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
KDM5DQ9BY66 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
KDM5DQ9BY66 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
KDM5DQ9BY66 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
KDM5DQ9BY66 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
KDM5DQ9BY66 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
KDM5DQ9BY66 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
KDM5DQ9BY66 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
KDM5DQ9BY66 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
KDM5DQ9BY66 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
KDM5DQ9BY66 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms