Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY12

SCAPER, S phase cyclin A-associated protein in the endoplasmic reticulum, humanhuman

Predictions only

Length 1,400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAPERQ9BY12 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
SCAPERQ9BY12 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
SCAPERQ9BY12 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
SCAPERQ9BY12 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SCAPERQ9BY12 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SCAPERQ9BY12 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SCAPERQ9BY12 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
SCAPERQ9BY12 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
SCAPERQ9BY12 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
SCAPERQ9BY12 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.94■■■□□ 2.22
SCAPERQ9BY12 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
SCAPERQ9BY12 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SCAPERQ9BY12 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SCAPERQ9BY12 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
SCAPERQ9BY12 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
SCAPERQ9BY12 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
SCAPERQ9BY12 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
SCAPERQ9BY12 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SCAPERQ9BY12 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
SCAPERQ9BY12 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC28.94■■■□□ 2.22
SCAPERQ9BY12 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
SCAPERQ9BY12 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
SCAPERQ9BY12 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
SCAPERQ9BY12 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
SCAPERQ9BY12 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
SCAPERQ9BY12 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
SCAPERQ9BY12 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
SCAPERQ9BY12 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
SCAPERQ9BY12 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
SCAPERQ9BY12 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
SCAPERQ9BY12 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
SCAPERQ9BY12 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
SCAPERQ9BY12 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
SCAPERQ9BY12 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
SCAPERQ9BY12 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
SCAPERQ9BY12 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
SCAPERQ9BY12 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
SCAPERQ9BY12 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
SCAPERQ9BY12 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
SCAPERQ9BY12 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
SCAPERQ9BY12 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
SCAPERQ9BY12 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
SCAPERQ9BY12 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
SCAPERQ9BY12 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
SCAPERQ9BY12 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC28.92■■■□□ 2.22
SCAPERQ9BY12 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC28.92■■■□□ 2.22
SCAPERQ9BY12 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
SCAPERQ9BY12 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC28.92■■■□□ 2.22
SCAPERQ9BY12 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
SCAPERQ9BY12 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
SCAPERQ9BY12 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
SCAPERQ9BY12 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
SCAPERQ9BY12 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
SCAPERQ9BY12 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
SCAPERQ9BY12 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
SCAPERQ9BY12 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
SCAPERQ9BY12 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
SCAPERQ9BY12 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
SCAPERQ9BY12 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
SCAPERQ9BY12 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
SCAPERQ9BY12 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
SCAPERQ9BY12 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
SCAPERQ9BY12 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
SCAPERQ9BY12 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
SCAPERQ9BY12 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
SCAPERQ9BY12 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
SCAPERQ9BY12 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
SCAPERQ9BY12 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
SCAPERQ9BY12 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
SCAPERQ9BY12 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
SCAPERQ9BY12 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
SCAPERQ9BY12 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
SCAPERQ9BY12 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
SCAPERQ9BY12 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
SCAPERQ9BY12 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
SCAPERQ9BY12 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
SCAPERQ9BY12 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
SCAPERQ9BY12 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
SCAPERQ9BY12 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
SCAPERQ9BY12 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
SCAPERQ9BY12 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
SCAPERQ9BY12 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
SCAPERQ9BY12 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
SCAPERQ9BY12 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC28.89■■■□□ 2.21
SCAPERQ9BY12 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
SCAPERQ9BY12 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
SCAPERQ9BY12 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
SCAPERQ9BY12 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
SCAPERQ9BY12 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
SCAPERQ9BY12 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
SCAPERQ9BY12 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
SCAPERQ9BY12 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
SCAPERQ9BY12 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
SCAPERQ9BY12 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
SCAPERQ9BY12 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
SCAPERQ9BY12 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
SCAPERQ9BY12 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
SCAPERQ9BY12 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
SCAPERQ9BY12 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
SCAPERQ9BY12 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms