Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY07

SLC4A5, Electrogenic sodium bicarbonate cotransporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A5Q9BY07 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC4A5Q9BY07 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC4A5Q9BY07 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC4A5Q9BY07 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC4A5Q9BY07 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC4A5Q9BY07 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC4A5Q9BY07 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC4A5Q9BY07 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC4A5Q9BY07 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC4A5Q9BY07 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC4A5Q9BY07 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC4A5Q9BY07 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC4A5Q9BY07 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC4A5Q9BY07 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC4A5Q9BY07 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC4A5Q9BY07 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC4A5Q9BY07 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC4A5Q9BY07 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC4A5Q9BY07 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC4A5Q9BY07 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC4A5Q9BY07 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
SLC4A5Q9BY07 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLC4A5Q9BY07 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLC4A5Q9BY07 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLC4A5Q9BY07 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLC4A5Q9BY07 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLC4A5Q9BY07 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLC4A5Q9BY07 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLC4A5Q9BY07 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLC4A5Q9BY07 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
SLC4A5Q9BY07 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
SLC4A5Q9BY07 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLC4A5Q9BY07 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLC4A5Q9BY07 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLC4A5Q9BY07 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLC4A5Q9BY07 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLC4A5Q9BY07 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLC4A5Q9BY07 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLC4A5Q9BY07 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLC4A5Q9BY07 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
SLC4A5Q9BY07 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
SLC4A5Q9BY07 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLC4A5Q9BY07 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLC4A5Q9BY07 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLC4A5Q9BY07 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLC4A5Q9BY07 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLC4A5Q9BY07 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLC4A5Q9BY07 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC4A5Q9BY07 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC4A5Q9BY07 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC4A5Q9BY07 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC4A5Q9BY07 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC4A5Q9BY07 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC4A5Q9BY07 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC4A5Q9BY07 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC4A5Q9BY07 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC4A5Q9BY07 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC4A5Q9BY07 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC4A5Q9BY07 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC4A5Q9BY07 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC4A5Q9BY07 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC4A5Q9BY07 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC4A5Q9BY07 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC4A5Q9BY07 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC4A5Q9BY07 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC4A5Q9BY07 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC4A5Q9BY07 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC4A5Q9BY07 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC4A5Q9BY07 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC4A5Q9BY07 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC4A5Q9BY07 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC4A5Q9BY07 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC4A5Q9BY07 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC4A5Q9BY07 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC4A5Q9BY07 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC4A5Q9BY07 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC4A5Q9BY07 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC4A5Q9BY07 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC4A5Q9BY07 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC4A5Q9BY07 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC4A5Q9BY07 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC4A5Q9BY07 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC4A5Q9BY07 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC4A5Q9BY07 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC4A5Q9BY07 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC4A5Q9BY07 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC4A5Q9BY07 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC4A5Q9BY07 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC4A5Q9BY07 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC4A5Q9BY07 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC4A5Q9BY07 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC4A5Q9BY07 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC4A5Q9BY07 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC4A5Q9BY07 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC4A5Q9BY07 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC4A5Q9BY07 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC4A5Q9BY07 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC4A5Q9BY07 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC4A5Q9BY07 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC4A5Q9BY07 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms