Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXY4

RSPO3, R-spondin-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSPO3Q9BXY4 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RSPO3Q9BXY4 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RSPO3Q9BXY4 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RSPO3Q9BXY4 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RSPO3Q9BXY4 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RSPO3Q9BXY4 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RSPO3Q9BXY4 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RSPO3Q9BXY4 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RSPO3Q9BXY4 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RSPO3Q9BXY4 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RSPO3Q9BXY4 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RSPO3Q9BXY4 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RSPO3Q9BXY4 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RSPO3Q9BXY4 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RSPO3Q9BXY4 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RSPO3Q9BXY4 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RSPO3Q9BXY4 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RSPO3Q9BXY4 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RSPO3Q9BXY4 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RSPO3Q9BXY4 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RSPO3Q9BXY4 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RSPO3Q9BXY4 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RSPO3Q9BXY4 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RSPO3Q9BXY4 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RSPO3Q9BXY4 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RSPO3Q9BXY4 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RSPO3Q9BXY4 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RSPO3Q9BXY4 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RSPO3Q9BXY4 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RSPO3Q9BXY4 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RSPO3Q9BXY4 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RSPO3Q9BXY4 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RSPO3Q9BXY4 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RSPO3Q9BXY4 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RSPO3Q9BXY4 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RSPO3Q9BXY4 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RSPO3Q9BXY4 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RSPO3Q9BXY4 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RSPO3Q9BXY4 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RSPO3Q9BXY4 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RSPO3Q9BXY4 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RSPO3Q9BXY4 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RSPO3Q9BXY4 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RSPO3Q9BXY4 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RSPO3Q9BXY4 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RSPO3Q9BXY4 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RSPO3Q9BXY4 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RSPO3Q9BXY4 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RSPO3Q9BXY4 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
RSPO3Q9BXY4 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RSPO3Q9BXY4 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RSPO3Q9BXY4 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RSPO3Q9BXY4 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RSPO3Q9BXY4 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RSPO3Q9BXY4 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RSPO3Q9BXY4 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RSPO3Q9BXY4 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RSPO3Q9BXY4 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RSPO3Q9BXY4 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RSPO3Q9BXY4 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RSPO3Q9BXY4 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RSPO3Q9BXY4 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RSPO3Q9BXY4 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RSPO3Q9BXY4 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RSPO3Q9BXY4 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RSPO3Q9BXY4 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RSPO3Q9BXY4 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RSPO3Q9BXY4 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RSPO3Q9BXY4 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RSPO3Q9BXY4 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RSPO3Q9BXY4 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RSPO3Q9BXY4 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RSPO3Q9BXY4 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RSPO3Q9BXY4 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RSPO3Q9BXY4 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RSPO3Q9BXY4 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RSPO3Q9BXY4 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RSPO3Q9BXY4 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
RSPO3Q9BXY4 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
RSPO3Q9BXY4 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
RSPO3Q9BXY4 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
RSPO3Q9BXY4 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
RSPO3Q9BXY4 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
RSPO3Q9BXY4 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
RSPO3Q9BXY4 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
RSPO3Q9BXY4 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RSPO3Q9BXY4 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
RSPO3Q9BXY4 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RSPO3Q9BXY4 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RSPO3Q9BXY4 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RSPO3Q9BXY4 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
RSPO3Q9BXY4 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RSPO3Q9BXY4 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RSPO3Q9BXY4 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
RSPO3Q9BXY4 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RSPO3Q9BXY4 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
RSPO3Q9BXY4 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RSPO3Q9BXY4 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
RSPO3Q9BXY4 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
RSPO3Q9BXY4 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms