Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW4

MAP1LC3C, Microtubule-associated proteins 1A/1B light chain 3C, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP1LC3CQ9BXW4 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
MAP1LC3CQ9BXW4 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
MAP1LC3CQ9BXW4 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
MAP1LC3CQ9BXW4 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
MAP1LC3CQ9BXW4 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
MAP1LC3CQ9BXW4 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
MAP1LC3CQ9BXW4 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
MAP1LC3CQ9BXW4 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
MAP1LC3CQ9BXW4 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
MAP1LC3CQ9BXW4 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
MAP1LC3CQ9BXW4 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
MAP1LC3CQ9BXW4 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
MAP1LC3CQ9BXW4 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
MAP1LC3CQ9BXW4 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
MAP1LC3CQ9BXW4 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
MAP1LC3CQ9BXW4 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
MAP1LC3CQ9BXW4 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
MAP1LC3CQ9BXW4 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
MAP1LC3CQ9BXW4 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
MAP1LC3CQ9BXW4 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
MAP1LC3CQ9BXW4 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
MAP1LC3CQ9BXW4 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
MAP1LC3CQ9BXW4 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
MAP1LC3CQ9BXW4 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
MAP1LC3CQ9BXW4 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
MAP1LC3CQ9BXW4 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
MAP1LC3CQ9BXW4 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
MAP1LC3CQ9BXW4 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
MAP1LC3CQ9BXW4 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
MAP1LC3CQ9BXW4 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
MAP1LC3CQ9BXW4 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
MAP1LC3CQ9BXW4 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
MAP1LC3CQ9BXW4 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
MAP1LC3CQ9BXW4 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
MAP1LC3CQ9BXW4 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
MAP1LC3CQ9BXW4 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
MAP1LC3CQ9BXW4 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
MAP1LC3CQ9BXW4 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
MAP1LC3CQ9BXW4 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
MAP1LC3CQ9BXW4 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
MAP1LC3CQ9BXW4 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
MAP1LC3CQ9BXW4 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
MAP1LC3CQ9BXW4 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
MAP1LC3CQ9BXW4 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
MAP1LC3CQ9BXW4 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
MAP1LC3CQ9BXW4 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
MAP1LC3CQ9BXW4 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
MAP1LC3CQ9BXW4 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
MAP1LC3CQ9BXW4 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
MAP1LC3CQ9BXW4 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
MAP1LC3CQ9BXW4 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
MAP1LC3CQ9BXW4 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
MAP1LC3CQ9BXW4 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
MAP1LC3CQ9BXW4 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
MAP1LC3CQ9BXW4 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
MAP1LC3CQ9BXW4 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
MAP1LC3CQ9BXW4 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
MAP1LC3CQ9BXW4 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
MAP1LC3CQ9BXW4 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
MAP1LC3CQ9BXW4 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
MAP1LC3CQ9BXW4 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
MAP1LC3CQ9BXW4 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
MAP1LC3CQ9BXW4 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
MAP1LC3CQ9BXW4 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
MAP1LC3CQ9BXW4 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
MAP1LC3CQ9BXW4 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
MAP1LC3CQ9BXW4 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
MAP1LC3CQ9BXW4 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
MAP1LC3CQ9BXW4 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
MAP1LC3CQ9BXW4 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
MAP1LC3CQ9BXW4 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
MAP1LC3CQ9BXW4 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
MAP1LC3CQ9BXW4 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
MAP1LC3CQ9BXW4 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
MAP1LC3CQ9BXW4 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
MAP1LC3CQ9BXW4 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
MAP1LC3CQ9BXW4 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
MAP1LC3CQ9BXW4 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
MAP1LC3CQ9BXW4 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
MAP1LC3CQ9BXW4 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
MAP1LC3CQ9BXW4 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
MAP1LC3CQ9BXW4 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
MAP1LC3CQ9BXW4 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
MAP1LC3CQ9BXW4 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
MAP1LC3CQ9BXW4 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
MAP1LC3CQ9BXW4 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
MAP1LC3CQ9BXW4 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
MAP1LC3CQ9BXW4 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
MAP1LC3CQ9BXW4 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
MAP1LC3CQ9BXW4 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
MAP1LC3CQ9BXW4 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
MAP1LC3CQ9BXW4 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
MAP1LC3CQ9BXW4 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
MAP1LC3CQ9BXW4 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
MAP1LC3CQ9BXW4 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
MAP1LC3CQ9BXW4 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
MAP1LC3CQ9BXW4 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms