Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUI4

POLR3C, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 534 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR3CQ9BUI4 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
POLR3CQ9BUI4 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
POLR3CQ9BUI4 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
POLR3CQ9BUI4 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
POLR3CQ9BUI4 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
POLR3CQ9BUI4 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
POLR3CQ9BUI4 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
POLR3CQ9BUI4 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
POLR3CQ9BUI4 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
POLR3CQ9BUI4 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
POLR3CQ9BUI4 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
POLR3CQ9BUI4 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
POLR3CQ9BUI4 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
POLR3CQ9BUI4 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
POLR3CQ9BUI4 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
POLR3CQ9BUI4 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
POLR3CQ9BUI4 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
POLR3CQ9BUI4 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
POLR3CQ9BUI4 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
POLR3CQ9BUI4 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
POLR3CQ9BUI4 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
POLR3CQ9BUI4 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
POLR3CQ9BUI4 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
POLR3CQ9BUI4 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
POLR3CQ9BUI4 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
POLR3CQ9BUI4 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
POLR3CQ9BUI4 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
POLR3CQ9BUI4 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
POLR3CQ9BUI4 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
POLR3CQ9BUI4 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
POLR3CQ9BUI4 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
POLR3CQ9BUI4 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
POLR3CQ9BUI4 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
POLR3CQ9BUI4 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
POLR3CQ9BUI4 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
POLR3CQ9BUI4 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
POLR3CQ9BUI4 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
POLR3CQ9BUI4 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
POLR3CQ9BUI4 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
POLR3CQ9BUI4 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
POLR3CQ9BUI4 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
POLR3CQ9BUI4 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
POLR3CQ9BUI4 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
POLR3CQ9BUI4 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
POLR3CQ9BUI4 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
POLR3CQ9BUI4 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
POLR3CQ9BUI4 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
POLR3CQ9BUI4 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
POLR3CQ9BUI4 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
POLR3CQ9BUI4 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
POLR3CQ9BUI4 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
POLR3CQ9BUI4 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
POLR3CQ9BUI4 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
POLR3CQ9BUI4 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
POLR3CQ9BUI4 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
POLR3CQ9BUI4 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
POLR3CQ9BUI4 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
POLR3CQ9BUI4 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
POLR3CQ9BUI4 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
POLR3CQ9BUI4 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
POLR3CQ9BUI4 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
POLR3CQ9BUI4 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
POLR3CQ9BUI4 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
POLR3CQ9BUI4 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
POLR3CQ9BUI4 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
POLR3CQ9BUI4 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
POLR3CQ9BUI4 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
POLR3CQ9BUI4 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
POLR3CQ9BUI4 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
POLR3CQ9BUI4 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
POLR3CQ9BUI4 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
POLR3CQ9BUI4 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
POLR3CQ9BUI4 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
POLR3CQ9BUI4 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
POLR3CQ9BUI4 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
POLR3CQ9BUI4 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
POLR3CQ9BUI4 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
POLR3CQ9BUI4 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
POLR3CQ9BUI4 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
POLR3CQ9BUI4 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
POLR3CQ9BUI4 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
POLR3CQ9BUI4 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
POLR3CQ9BUI4 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
POLR3CQ9BUI4 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
POLR3CQ9BUI4 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
POLR3CQ9BUI4 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
POLR3CQ9BUI4 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
POLR3CQ9BUI4 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
POLR3CQ9BUI4 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
POLR3CQ9BUI4 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
POLR3CQ9BUI4 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
POLR3CQ9BUI4 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
POLR3CQ9BUI4 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
POLR3CQ9BUI4 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
POLR3CQ9BUI4 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
POLR3CQ9BUI4 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
POLR3CQ9BUI4 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
POLR3CQ9BUI4 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
POLR3CQ9BUI4 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
POLR3CQ9BUI4 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84 ms