Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSW2

CRACR2A, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 4B, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRACR2AQ9BSW2 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CRACR2AQ9BSW2 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CRACR2AQ9BSW2 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CRACR2AQ9BSW2 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CRACR2AQ9BSW2 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CRACR2AQ9BSW2 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CRACR2AQ9BSW2 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
CRACR2AQ9BSW2 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CRACR2AQ9BSW2 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CRACR2AQ9BSW2 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CRACR2AQ9BSW2 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CRACR2AQ9BSW2 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CRACR2AQ9BSW2 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CRACR2AQ9BSW2 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CRACR2AQ9BSW2 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CRACR2AQ9BSW2 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CRACR2AQ9BSW2 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CRACR2AQ9BSW2 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CRACR2AQ9BSW2 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CRACR2AQ9BSW2 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CRACR2AQ9BSW2 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CRACR2AQ9BSW2 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CRACR2AQ9BSW2 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CRACR2AQ9BSW2 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CRACR2AQ9BSW2 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CRACR2AQ9BSW2 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CRACR2AQ9BSW2 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CRACR2AQ9BSW2 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CRACR2AQ9BSW2 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CRACR2AQ9BSW2 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CRACR2AQ9BSW2 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CRACR2AQ9BSW2 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CRACR2AQ9BSW2 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CRACR2AQ9BSW2 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CRACR2AQ9BSW2 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CRACR2AQ9BSW2 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CRACR2AQ9BSW2 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CRACR2AQ9BSW2 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CRACR2AQ9BSW2 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CRACR2AQ9BSW2 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CRACR2AQ9BSW2 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CRACR2AQ9BSW2 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CRACR2AQ9BSW2 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CRACR2AQ9BSW2 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CRACR2AQ9BSW2 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CRACR2AQ9BSW2 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CRACR2AQ9BSW2 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CRACR2AQ9BSW2 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CRACR2AQ9BSW2 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CRACR2AQ9BSW2 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CRACR2AQ9BSW2 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CRACR2AQ9BSW2 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CRACR2AQ9BSW2 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CRACR2AQ9BSW2 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
CRACR2AQ9BSW2 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CRACR2AQ9BSW2 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CRACR2AQ9BSW2 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CRACR2AQ9BSW2 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CRACR2AQ9BSW2 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
CRACR2AQ9BSW2 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
CRACR2AQ9BSW2 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
CRACR2AQ9BSW2 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CRACR2AQ9BSW2 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CRACR2AQ9BSW2 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CRACR2AQ9BSW2 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CRACR2AQ9BSW2 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CRACR2AQ9BSW2 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CRACR2AQ9BSW2 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CRACR2AQ9BSW2 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CRACR2AQ9BSW2 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CRACR2AQ9BSW2 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CRACR2AQ9BSW2 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CRACR2AQ9BSW2 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CRACR2AQ9BSW2 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
CRACR2AQ9BSW2 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CRACR2AQ9BSW2 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CRACR2AQ9BSW2 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
CRACR2AQ9BSW2 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CRACR2AQ9BSW2 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CRACR2AQ9BSW2 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CRACR2AQ9BSW2 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CRACR2AQ9BSW2 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CRACR2AQ9BSW2 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CRACR2AQ9BSW2 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CRACR2AQ9BSW2 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CRACR2AQ9BSW2 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CRACR2AQ9BSW2 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CRACR2AQ9BSW2 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CRACR2AQ9BSW2 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CRACR2AQ9BSW2 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CRACR2AQ9BSW2 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CRACR2AQ9BSW2 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CRACR2AQ9BSW2 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
CRACR2AQ9BSW2 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CRACR2AQ9BSW2 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CRACR2AQ9BSW2 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CRACR2AQ9BSW2 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CRACR2AQ9BSW2 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CRACR2AQ9BSW2 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
CRACR2AQ9BSW2 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms