Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQI6

SLF1, SMC5-SMC6 complex localization factor protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,058 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLF1Q9BQI6 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLF1Q9BQI6 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLF1Q9BQI6 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLF1Q9BQI6 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLF1Q9BQI6 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLF1Q9BQI6 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLF1Q9BQI6 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLF1Q9BQI6 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLF1Q9BQI6 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLF1Q9BQI6 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLF1Q9BQI6 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLF1Q9BQI6 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLF1Q9BQI6 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLF1Q9BQI6 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLF1Q9BQI6 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLF1Q9BQI6 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLF1Q9BQI6 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLF1Q9BQI6 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLF1Q9BQI6 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLF1Q9BQI6 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SLF1Q9BQI6 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SLF1Q9BQI6 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLF1Q9BQI6 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLF1Q9BQI6 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLF1Q9BQI6 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLF1Q9BQI6 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLF1Q9BQI6 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLF1Q9BQI6 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLF1Q9BQI6 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLF1Q9BQI6 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLF1Q9BQI6 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLF1Q9BQI6 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
SLF1Q9BQI6 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLF1Q9BQI6 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLF1Q9BQI6 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLF1Q9BQI6 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLF1Q9BQI6 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLF1Q9BQI6 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLF1Q9BQI6 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLF1Q9BQI6 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLF1Q9BQI6 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLF1Q9BQI6 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLF1Q9BQI6 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLF1Q9BQI6 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SLF1Q9BQI6 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SLF1Q9BQI6 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SLF1Q9BQI6 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SLF1Q9BQI6 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLF1Q9BQI6 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLF1Q9BQI6 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLF1Q9BQI6 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLF1Q9BQI6 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLF1Q9BQI6 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLF1Q9BQI6 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLF1Q9BQI6 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLF1Q9BQI6 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLF1Q9BQI6 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLF1Q9BQI6 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLF1Q9BQI6 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SLF1Q9BQI6 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLF1Q9BQI6 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLF1Q9BQI6 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLF1Q9BQI6 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SLF1Q9BQI6 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLF1Q9BQI6 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLF1Q9BQI6 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLF1Q9BQI6 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLF1Q9BQI6 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLF1Q9BQI6 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLF1Q9BQI6 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLF1Q9BQI6 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SLF1Q9BQI6 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLF1Q9BQI6 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLF1Q9BQI6 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLF1Q9BQI6 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLF1Q9BQI6 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLF1Q9BQI6 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLF1Q9BQI6 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLF1Q9BQI6 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLF1Q9BQI6 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLF1Q9BQI6 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLF1Q9BQI6 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLF1Q9BQI6 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SLF1Q9BQI6 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLF1Q9BQI6 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLF1Q9BQI6 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLF1Q9BQI6 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLF1Q9BQI6 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SLF1Q9BQI6 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLF1Q9BQI6 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLF1Q9BQI6 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLF1Q9BQI6 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLF1Q9BQI6 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLF1Q9BQI6 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLF1Q9BQI6 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLF1Q9BQI6 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLF1Q9BQI6 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLF1Q9BQI6 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLF1Q9BQI6 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLF1Q9BQI6 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms