Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ50

TREX2, Three prime repair exonuclease 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TREX2Q9BQ50 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TREX2Q9BQ50 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TREX2Q9BQ50 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TREX2Q9BQ50 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TREX2Q9BQ50 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TREX2Q9BQ50 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
TREX2Q9BQ50 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TREX2Q9BQ50 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TREX2Q9BQ50 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TREX2Q9BQ50 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TREX2Q9BQ50 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TREX2Q9BQ50 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TREX2Q9BQ50 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TREX2Q9BQ50 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TREX2Q9BQ50 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TREX2Q9BQ50 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TREX2Q9BQ50 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TREX2Q9BQ50 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TREX2Q9BQ50 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TREX2Q9BQ50 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TREX2Q9BQ50 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TREX2Q9BQ50 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TREX2Q9BQ50 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TREX2Q9BQ50 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TREX2Q9BQ50 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TREX2Q9BQ50 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TREX2Q9BQ50 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TREX2Q9BQ50 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TREX2Q9BQ50 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TREX2Q9BQ50 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TREX2Q9BQ50 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
TREX2Q9BQ50 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TREX2Q9BQ50 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TREX2Q9BQ50 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TREX2Q9BQ50 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TREX2Q9BQ50 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TREX2Q9BQ50 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
TREX2Q9BQ50 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TREX2Q9BQ50 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TREX2Q9BQ50 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
TREX2Q9BQ50 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TREX2Q9BQ50 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TREX2Q9BQ50 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TREX2Q9BQ50 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TREX2Q9BQ50 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TREX2Q9BQ50 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TREX2Q9BQ50 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TREX2Q9BQ50 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
TREX2Q9BQ50 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TREX2Q9BQ50 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TREX2Q9BQ50 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TREX2Q9BQ50 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TREX2Q9BQ50 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TREX2Q9BQ50 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TREX2Q9BQ50 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TREX2Q9BQ50 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TREX2Q9BQ50 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TREX2Q9BQ50 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TREX2Q9BQ50 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TREX2Q9BQ50 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
TREX2Q9BQ50 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TREX2Q9BQ50 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TREX2Q9BQ50 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TREX2Q9BQ50 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TREX2Q9BQ50 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
TREX2Q9BQ50 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TREX2Q9BQ50 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TREX2Q9BQ50 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TREX2Q9BQ50 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TREX2Q9BQ50 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TREX2Q9BQ50 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TREX2Q9BQ50 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TREX2Q9BQ50 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TREX2Q9BQ50 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TREX2Q9BQ50 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TREX2Q9BQ50 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TREX2Q9BQ50 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TREX2Q9BQ50 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TREX2Q9BQ50 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TREX2Q9BQ50 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TREX2Q9BQ50 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TREX2Q9BQ50 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TREX2Q9BQ50 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TREX2Q9BQ50 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TREX2Q9BQ50 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TREX2Q9BQ50 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TREX2Q9BQ50 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TREX2Q9BQ50 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TREX2Q9BQ50 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TREX2Q9BQ50 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TREX2Q9BQ50 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TREX2Q9BQ50 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TREX2Q9BQ50 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TREX2Q9BQ50 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TREX2Q9BQ50 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TREX2Q9BQ50 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TREX2Q9BQ50 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TREX2Q9BQ50 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TREX2Q9BQ50 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TREX2Q9BQ50 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms