Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ16

SPOCK3, Testican-3, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCK3Q9BQ16 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SPOCK3Q9BQ16 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SPOCK3Q9BQ16 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SPOCK3Q9BQ16 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SPOCK3Q9BQ16 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SPOCK3Q9BQ16 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SPOCK3Q9BQ16 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SPOCK3Q9BQ16 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SPOCK3Q9BQ16 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SPOCK3Q9BQ16 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SPOCK3Q9BQ16 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SPOCK3Q9BQ16 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SPOCK3Q9BQ16 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SPOCK3Q9BQ16 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SPOCK3Q9BQ16 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SPOCK3Q9BQ16 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SPOCK3Q9BQ16 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SPOCK3Q9BQ16 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SPOCK3Q9BQ16 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SPOCK3Q9BQ16 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SPOCK3Q9BQ16 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SPOCK3Q9BQ16 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SPOCK3Q9BQ16 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SPOCK3Q9BQ16 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SPOCK3Q9BQ16 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SPOCK3Q9BQ16 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SPOCK3Q9BQ16 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SPOCK3Q9BQ16 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SPOCK3Q9BQ16 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SPOCK3Q9BQ16 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SPOCK3Q9BQ16 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SPOCK3Q9BQ16 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SPOCK3Q9BQ16 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SPOCK3Q9BQ16 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SPOCK3Q9BQ16 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SPOCK3Q9BQ16 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SPOCK3Q9BQ16 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SPOCK3Q9BQ16 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SPOCK3Q9BQ16 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SPOCK3Q9BQ16 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SPOCK3Q9BQ16 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SPOCK3Q9BQ16 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SPOCK3Q9BQ16 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SPOCK3Q9BQ16 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SPOCK3Q9BQ16 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SPOCK3Q9BQ16 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SPOCK3Q9BQ16 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SPOCK3Q9BQ16 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SPOCK3Q9BQ16 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SPOCK3Q9BQ16 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SPOCK3Q9BQ16 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SPOCK3Q9BQ16 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SPOCK3Q9BQ16 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
SPOCK3Q9BQ16 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
SPOCK3Q9BQ16 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
SPOCK3Q9BQ16 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SPOCK3Q9BQ16 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SPOCK3Q9BQ16 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SPOCK3Q9BQ16 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SPOCK3Q9BQ16 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SPOCK3Q9BQ16 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SPOCK3Q9BQ16 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
SPOCK3Q9BQ16 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SPOCK3Q9BQ16 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SPOCK3Q9BQ16 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SPOCK3Q9BQ16 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SPOCK3Q9BQ16 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
SPOCK3Q9BQ16 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SPOCK3Q9BQ16 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SPOCK3Q9BQ16 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
SPOCK3Q9BQ16 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SPOCK3Q9BQ16 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SPOCK3Q9BQ16 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
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SPOCK3Q9BQ16 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.26
SPOCK3Q9BQ16 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
SPOCK3Q9BQ16 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
SPOCK3Q9BQ16 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SPOCK3Q9BQ16 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SPOCK3Q9BQ16 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SPOCK3Q9BQ16 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SPOCK3Q9BQ16 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SPOCK3Q9BQ16 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SPOCK3Q9BQ16 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SPOCK3Q9BQ16 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SPOCK3Q9BQ16 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
SPOCK3Q9BQ16 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
SPOCK3Q9BQ16 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SPOCK3Q9BQ16 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SPOCK3Q9BQ16 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SPOCK3Q9BQ16 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SPOCK3Q9BQ16 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SPOCK3Q9BQ16 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SPOCK3Q9BQ16 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SPOCK3Q9BQ16 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SPOCK3Q9BQ16 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
SPOCK3Q9BQ16 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SPOCK3Q9BQ16 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SPOCK3Q9BQ16 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SPOCK3Q9BQ16 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
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