Protein–RNA interactions for Protein: Q99952

PTPN18, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 18, humanhuman

Predictions only

Length 460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN18Q99952 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PTPN18Q99952 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PTPN18Q99952 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PTPN18Q99952 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PTPN18Q99952 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PTPN18Q99952 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PTPN18Q99952 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PTPN18Q99952 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PTPN18Q99952 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPN18Q99952 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPN18Q99952 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPN18Q99952 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPN18Q99952 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPN18Q99952 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPN18Q99952 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPN18Q99952 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPN18Q99952 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPN18Q99952 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPN18Q99952 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPN18Q99952 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPN18Q99952 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPN18Q99952 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPN18Q99952 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPN18Q99952 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPN18Q99952 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPN18Q99952 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPN18Q99952 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPN18Q99952 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPN18Q99952 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPN18Q99952 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPN18Q99952 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPN18Q99952 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPN18Q99952 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPN18Q99952 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPN18Q99952 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPN18Q99952 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPN18Q99952 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPN18Q99952 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPN18Q99952 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPN18Q99952 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPN18Q99952 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPN18Q99952 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPN18Q99952 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPN18Q99952 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPN18Q99952 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPN18Q99952 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPN18Q99952 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPN18Q99952 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPN18Q99952 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPN18Q99952 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPN18Q99952 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPN18Q99952 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPN18Q99952 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPN18Q99952 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPN18Q99952 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPN18Q99952 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPN18Q99952 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPN18Q99952 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPN18Q99952 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPN18Q99952 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPN18Q99952 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPN18Q99952 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPN18Q99952 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPN18Q99952 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPN18Q99952 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPN18Q99952 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPN18Q99952 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTPN18Q99952 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTPN18Q99952 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTPN18Q99952 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTPN18Q99952 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTPN18Q99952 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTPN18Q99952 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTPN18Q99952 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTPN18Q99952 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTPN18Q99952 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTPN18Q99952 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
PTPN18Q99952 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTPN18Q99952 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTPN18Q99952 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTPN18Q99952 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTPN18Q99952 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTPN18Q99952 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTPN18Q99952 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTPN18Q99952 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTPN18Q99952 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTPN18Q99952 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPN18Q99952 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPN18Q99952 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPN18Q99952 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPN18Q99952 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPN18Q99952 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPN18Q99952 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPN18Q99952 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPN18Q99952 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPN18Q99952 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPN18Q99952 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPN18Q99952 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPN18Q99952 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPN18Q99952 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms