Protein–RNA interactions for Protein: Q99836

MYD88, Myeloid differentiation primary response protein MyD88, humanhuman

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYD88Q99836 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MYD88Q99836 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MYD88Q99836 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MYD88Q99836 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MYD88Q99836 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MYD88Q99836 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MYD88Q99836 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MYD88Q99836 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MYD88Q99836 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MYD88Q99836 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MYD88Q99836 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MYD88Q99836 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MYD88Q99836 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MYD88Q99836 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MYD88Q99836 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MYD88Q99836 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MYD88Q99836 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MYD88Q99836 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MYD88Q99836 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MYD88Q99836 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MYD88Q99836 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
MYD88Q99836 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MYD88Q99836 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MYD88Q99836 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MYD88Q99836 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MYD88Q99836 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MYD88Q99836 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MYD88Q99836 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MYD88Q99836 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MYD88Q99836 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MYD88Q99836 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MYD88Q99836 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MYD88Q99836 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MYD88Q99836 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MYD88Q99836 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MYD88Q99836 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MYD88Q99836 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MYD88Q99836 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MYD88Q99836 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
MYD88Q99836 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MYD88Q99836 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MYD88Q99836 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MYD88Q99836 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MYD88Q99836 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MYD88Q99836 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MYD88Q99836 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MYD88Q99836 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MYD88Q99836 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MYD88Q99836 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MYD88Q99836 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MYD88Q99836 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MYD88Q99836 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MYD88Q99836 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MYD88Q99836 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MYD88Q99836 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MYD88Q99836 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MYD88Q99836 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MYD88Q99836 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MYD88Q99836 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MYD88Q99836 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MYD88Q99836 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
MYD88Q99836 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MYD88Q99836 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MYD88Q99836 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
MYD88Q99836 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MYD88Q99836 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MYD88Q99836 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MYD88Q99836 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MYD88Q99836 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MYD88Q99836 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MYD88Q99836 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MYD88Q99836 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MYD88Q99836 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MYD88Q99836 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MYD88Q99836 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MYD88Q99836 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
MYD88Q99836 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
MYD88Q99836 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.46
MYD88Q99836 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
MYD88Q99836 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
MYD88Q99836 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
MYD88Q99836 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
MYD88Q99836 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
MYD88Q99836 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
MYD88Q99836 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
MYD88Q99836 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
MYD88Q99836 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
MYD88Q99836 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
MYD88Q99836 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
MYD88Q99836 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
MYD88Q99836 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
MYD88Q99836 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
MYD88Q99836 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
MYD88Q99836 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
MYD88Q99836 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
MYD88Q99836 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
MYD88Q99836 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
MYD88Q99836 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
MYD88Q99836 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MYD88Q99836 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms