Protein–RNA interactions for Protein: Q99504

EYA3, Eyes absent homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 573 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EYA3Q99504 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
EYA3Q99504 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
EYA3Q99504 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
EYA3Q99504 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
EYA3Q99504 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
EYA3Q99504 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
EYA3Q99504 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
EYA3Q99504 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
EYA3Q99504 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
EYA3Q99504 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
EYA3Q99504 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
EYA3Q99504 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
EYA3Q99504 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
EYA3Q99504 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
EYA3Q99504 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
EYA3Q99504 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
EYA3Q99504 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
EYA3Q99504 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
EYA3Q99504 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
EYA3Q99504 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
EYA3Q99504 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
EYA3Q99504 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
EYA3Q99504 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
EYA3Q99504 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
EYA3Q99504 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
EYA3Q99504 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
EYA3Q99504 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
EYA3Q99504 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
EYA3Q99504 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
EYA3Q99504 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
EYA3Q99504 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
EYA3Q99504 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
EYA3Q99504 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
EYA3Q99504 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
EYA3Q99504 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
EYA3Q99504 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
EYA3Q99504 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
EYA3Q99504 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
EYA3Q99504 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
EYA3Q99504 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
EYA3Q99504 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
EYA3Q99504 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
EYA3Q99504 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
EYA3Q99504 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
EYA3Q99504 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
EYA3Q99504 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
EYA3Q99504 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
EYA3Q99504 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
EYA3Q99504 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
EYA3Q99504 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
EYA3Q99504 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
EYA3Q99504 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
EYA3Q99504 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
EYA3Q99504 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
EYA3Q99504 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
EYA3Q99504 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
EYA3Q99504 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
EYA3Q99504 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
EYA3Q99504 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
EYA3Q99504 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
EYA3Q99504 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
EYA3Q99504 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
EYA3Q99504 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
EYA3Q99504 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
EYA3Q99504 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
EYA3Q99504 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
EYA3Q99504 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
EYA3Q99504 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
EYA3Q99504 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
EYA3Q99504 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
EYA3Q99504 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
EYA3Q99504 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
EYA3Q99504 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
EYA3Q99504 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
EYA3Q99504 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
EYA3Q99504 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
EYA3Q99504 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
EYA3Q99504 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
EYA3Q99504 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
EYA3Q99504 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
EYA3Q99504 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
EYA3Q99504 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
EYA3Q99504 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
EYA3Q99504 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
EYA3Q99504 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
EYA3Q99504 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
EYA3Q99504 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
EYA3Q99504 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
EYA3Q99504 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
EYA3Q99504 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
EYA3Q99504 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
EYA3Q99504 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
EYA3Q99504 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
EYA3Q99504 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
EYA3Q99504 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
EYA3Q99504 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
EYA3Q99504 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
EYA3Q99504 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
EYA3Q99504 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
EYA3Q99504 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms