Protein–RNA interactions for Protein: Q99460

PSMD1, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD1Q99460 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PSMD1Q99460 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PSMD1Q99460 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PSMD1Q99460 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PSMD1Q99460 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PSMD1Q99460 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
PSMD1Q99460 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
PSMD1Q99460 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PSMD1Q99460 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PSMD1Q99460 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PSMD1Q99460 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PSMD1Q99460 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PSMD1Q99460 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PSMD1Q99460 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
PSMD1Q99460 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PSMD1Q99460 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PSMD1Q99460 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PSMD1Q99460 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PSMD1Q99460 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PSMD1Q99460 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PSMD1Q99460 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PSMD1Q99460 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PSMD1Q99460 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PSMD1Q99460 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PSMD1Q99460 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PSMD1Q99460 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PSMD1Q99460 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PSMD1Q99460 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PSMD1Q99460 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PSMD1Q99460 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PSMD1Q99460 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
PSMD1Q99460 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PSMD1Q99460 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PSMD1Q99460 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PSMD1Q99460 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PSMD1Q99460 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PSMD1Q99460 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PSMD1Q99460 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PSMD1Q99460 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PSMD1Q99460 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PSMD1Q99460 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PSMD1Q99460 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PSMD1Q99460 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
PSMD1Q99460 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PSMD1Q99460 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PSMD1Q99460 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PSMD1Q99460 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PSMD1Q99460 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PSMD1Q99460 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PSMD1Q99460 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PSMD1Q99460 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PSMD1Q99460 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PSMD1Q99460 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PSMD1Q99460 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PSMD1Q99460 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PSMD1Q99460 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PSMD1Q99460 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PSMD1Q99460 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PSMD1Q99460 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PSMD1Q99460 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PSMD1Q99460 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PSMD1Q99460 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PSMD1Q99460 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PSMD1Q99460 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PSMD1Q99460 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PSMD1Q99460 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
PSMD1Q99460 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PSMD1Q99460 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PSMD1Q99460 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PSMD1Q99460 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PSMD1Q99460 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PSMD1Q99460 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PSMD1Q99460 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PSMD1Q99460 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PSMD1Q99460 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PSMD1Q99460 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PSMD1Q99460 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PSMD1Q99460 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PSMD1Q99460 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PSMD1Q99460 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PSMD1Q99460 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PSMD1Q99460 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PSMD1Q99460 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PSMD1Q99460 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PSMD1Q99460 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PSMD1Q99460 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PSMD1Q99460 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PSMD1Q99460 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PSMD1Q99460 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PSMD1Q99460 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PSMD1Q99460 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PSMD1Q99460 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PSMD1Q99460 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PSMD1Q99460 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PSMD1Q99460 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
PSMD1Q99460 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PSMD1Q99460 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PSMD1Q99460 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PSMD1Q99460 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PSMD1Q99460 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms