Protein–RNA interactions for Protein: Q96ST3

SIN3A, Paired amphipathic helix protein Sin3a, humanhuman

Predictions only

Length 1,273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIN3AQ96ST3 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SIN3AQ96ST3 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SIN3AQ96ST3 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SIN3AQ96ST3 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SIN3AQ96ST3 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SIN3AQ96ST3 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SIN3AQ96ST3 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SIN3AQ96ST3 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SIN3AQ96ST3 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SIN3AQ96ST3 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SIN3AQ96ST3 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SIN3AQ96ST3 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SIN3AQ96ST3 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SIN3AQ96ST3 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
SIN3AQ96ST3 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SIN3AQ96ST3 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SIN3AQ96ST3 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SIN3AQ96ST3 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SIN3AQ96ST3 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SIN3AQ96ST3 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
SIN3AQ96ST3 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SIN3AQ96ST3 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SIN3AQ96ST3 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SIN3AQ96ST3 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SIN3AQ96ST3 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
SIN3AQ96ST3 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SIN3AQ96ST3 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SIN3AQ96ST3 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SIN3AQ96ST3 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
SIN3AQ96ST3 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
SIN3AQ96ST3 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SIN3AQ96ST3 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SIN3AQ96ST3 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SIN3AQ96ST3 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SIN3AQ96ST3 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SIN3AQ96ST3 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
SIN3AQ96ST3 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SIN3AQ96ST3 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SIN3AQ96ST3 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SIN3AQ96ST3 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SIN3AQ96ST3 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SIN3AQ96ST3 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SIN3AQ96ST3 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SIN3AQ96ST3 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SIN3AQ96ST3 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SIN3AQ96ST3 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SIN3AQ96ST3 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SIN3AQ96ST3 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SIN3AQ96ST3 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SIN3AQ96ST3 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SIN3AQ96ST3 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SIN3AQ96ST3 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SIN3AQ96ST3 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
SIN3AQ96ST3 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
SIN3AQ96ST3 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
SIN3AQ96ST3 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
SIN3AQ96ST3 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
SIN3AQ96ST3 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
SIN3AQ96ST3 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
SIN3AQ96ST3 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
SIN3AQ96ST3 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
SIN3AQ96ST3 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
SIN3AQ96ST3 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SIN3AQ96ST3 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SIN3AQ96ST3 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SIN3AQ96ST3 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SIN3AQ96ST3 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SIN3AQ96ST3 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SIN3AQ96ST3 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SIN3AQ96ST3 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SIN3AQ96ST3 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
SIN3AQ96ST3 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SIN3AQ96ST3 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SIN3AQ96ST3 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SIN3AQ96ST3 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SIN3AQ96ST3 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SIN3AQ96ST3 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SIN3AQ96ST3 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SIN3AQ96ST3 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
SIN3AQ96ST3 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SIN3AQ96ST3 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SIN3AQ96ST3 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SIN3AQ96ST3 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SIN3AQ96ST3 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SIN3AQ96ST3 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SIN3AQ96ST3 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SIN3AQ96ST3 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SIN3AQ96ST3 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SIN3AQ96ST3 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SIN3AQ96ST3 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SIN3AQ96ST3 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SIN3AQ96ST3 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SIN3AQ96ST3 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SIN3AQ96ST3 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
SIN3AQ96ST3 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SIN3AQ96ST3 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SIN3AQ96ST3 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SIN3AQ96ST3 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
SIN3AQ96ST3 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SIN3AQ96ST3 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms