Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q05

TRAPPC9, Trafficking protein particle complex subunit 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC9Q96Q05 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
TRAPPC9Q96Q05 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRAPPC9Q96Q05 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRAPPC9Q96Q05 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRAPPC9Q96Q05 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRAPPC9Q96Q05 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRAPPC9Q96Q05 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRAPPC9Q96Q05 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
TRAPPC9Q96Q05 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRAPPC9Q96Q05 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRAPPC9Q96Q05 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRAPPC9Q96Q05 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRAPPC9Q96Q05 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRAPPC9Q96Q05 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRAPPC9Q96Q05 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRAPPC9Q96Q05 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRAPPC9Q96Q05 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRAPPC9Q96Q05 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRAPPC9Q96Q05 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRAPPC9Q96Q05 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRAPPC9Q96Q05 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRAPPC9Q96Q05 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRAPPC9Q96Q05 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRAPPC9Q96Q05 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRAPPC9Q96Q05 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRAPPC9Q96Q05 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRAPPC9Q96Q05 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
TRAPPC9Q96Q05 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRAPPC9Q96Q05 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRAPPC9Q96Q05 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRAPPC9Q96Q05 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRAPPC9Q96Q05 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRAPPC9Q96Q05 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRAPPC9Q96Q05 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRAPPC9Q96Q05 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRAPPC9Q96Q05 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRAPPC9Q96Q05 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRAPPC9Q96Q05 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRAPPC9Q96Q05 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRAPPC9Q96Q05 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRAPPC9Q96Q05 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRAPPC9Q96Q05 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRAPPC9Q96Q05 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRAPPC9Q96Q05 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRAPPC9Q96Q05 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRAPPC9Q96Q05 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRAPPC9Q96Q05 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRAPPC9Q96Q05 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRAPPC9Q96Q05 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRAPPC9Q96Q05 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
TRAPPC9Q96Q05 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRAPPC9Q96Q05 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRAPPC9Q96Q05 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRAPPC9Q96Q05 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRAPPC9Q96Q05 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRAPPC9Q96Q05 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRAPPC9Q96Q05 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRAPPC9Q96Q05 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRAPPC9Q96Q05 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRAPPC9Q96Q05 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRAPPC9Q96Q05 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRAPPC9Q96Q05 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
TRAPPC9Q96Q05 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRAPPC9Q96Q05 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRAPPC9Q96Q05 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRAPPC9Q96Q05 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRAPPC9Q96Q05 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRAPPC9Q96Q05 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRAPPC9Q96Q05 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRAPPC9Q96Q05 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRAPPC9Q96Q05 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRAPPC9Q96Q05 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRAPPC9Q96Q05 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRAPPC9Q96Q05 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRAPPC9Q96Q05 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRAPPC9Q96Q05 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRAPPC9Q96Q05 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRAPPC9Q96Q05 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRAPPC9Q96Q05 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRAPPC9Q96Q05 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRAPPC9Q96Q05 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRAPPC9Q96Q05 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRAPPC9Q96Q05 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRAPPC9Q96Q05 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRAPPC9Q96Q05 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRAPPC9Q96Q05 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRAPPC9Q96Q05 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRAPPC9Q96Q05 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
TRAPPC9Q96Q05 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRAPPC9Q96Q05 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRAPPC9Q96Q05 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRAPPC9Q96Q05 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRAPPC9Q96Q05 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRAPPC9Q96Q05 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRAPPC9Q96Q05 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRAPPC9Q96Q05 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRAPPC9Q96Q05 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRAPPC9Q96Q05 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRAPPC9Q96Q05 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TRAPPC9Q96Q05 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms