Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q04

LMTK3, Serine/threonine-protein kinase LMTK3, humanhuman

Predictions only

Length 1,460 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMTK3Q96Q04 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
LMTK3Q96Q04 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
LMTK3Q96Q04 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
LMTK3Q96Q04 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
LMTK3Q96Q04 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
LMTK3Q96Q04 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
LMTK3Q96Q04 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
LMTK3Q96Q04 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
LMTK3Q96Q04 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
LMTK3Q96Q04 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
LMTK3Q96Q04 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.65■■■□□ 2.02
LMTK3Q96Q04 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC27.65■■■□□ 2.02
LMTK3Q96Q04 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
LMTK3Q96Q04 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
LMTK3Q96Q04 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
LMTK3Q96Q04 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
LMTK3Q96Q04 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
LMTK3Q96Q04 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
LMTK3Q96Q04 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
LMTK3Q96Q04 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
LMTK3Q96Q04 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
LMTK3Q96Q04 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
LMTK3Q96Q04 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
LMTK3Q96Q04 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
LMTK3Q96Q04 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
LMTK3Q96Q04 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
LMTK3Q96Q04 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC27.64■■■□□ 2.02
LMTK3Q96Q04 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
LMTK3Q96Q04 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
LMTK3Q96Q04 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
LMTK3Q96Q04 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
LMTK3Q96Q04 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
LMTK3Q96Q04 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
LMTK3Q96Q04 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
LMTK3Q96Q04 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
LMTK3Q96Q04 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
LMTK3Q96Q04 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
LMTK3Q96Q04 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
LMTK3Q96Q04 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
LMTK3Q96Q04 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
LMTK3Q96Q04 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
LMTK3Q96Q04 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC27.64■■■□□ 2.01
LMTK3Q96Q04 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
LMTK3Q96Q04 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
LMTK3Q96Q04 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC27.64■■■□□ 2.01
LMTK3Q96Q04 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
LMTK3Q96Q04 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
LMTK3Q96Q04 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
LMTK3Q96Q04 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
LMTK3Q96Q04 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
LMTK3Q96Q04 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
LMTK3Q96Q04 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
LMTK3Q96Q04 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
LMTK3Q96Q04 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
LMTK3Q96Q04 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
LMTK3Q96Q04 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
LMTK3Q96Q04 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
LMTK3Q96Q04 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
LMTK3Q96Q04 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
LMTK3Q96Q04 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
LMTK3Q96Q04 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
LMTK3Q96Q04 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
LMTK3Q96Q04 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
LMTK3Q96Q04 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
LMTK3Q96Q04 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
LMTK3Q96Q04 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
LMTK3Q96Q04 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
LMTK3Q96Q04 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
LMTK3Q96Q04 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
LMTK3Q96Q04 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
LMTK3Q96Q04 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
LMTK3Q96Q04 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
LMTK3Q96Q04 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
LMTK3Q96Q04 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
LMTK3Q96Q04 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
LMTK3Q96Q04 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
LMTK3Q96Q04 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
LMTK3Q96Q04 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
LMTK3Q96Q04 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC27.61■■■□□ 2.01
LMTK3Q96Q04 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
LMTK3Q96Q04 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
LMTK3Q96Q04 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
LMTK3Q96Q04 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
LMTK3Q96Q04 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
LMTK3Q96Q04 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
LMTK3Q96Q04 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
LMTK3Q96Q04 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
LMTK3Q96Q04 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
LMTK3Q96Q04 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
LMTK3Q96Q04 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
LMTK3Q96Q04 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
LMTK3Q96Q04 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
LMTK3Q96Q04 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
LMTK3Q96Q04 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
LMTK3Q96Q04 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
LMTK3Q96Q04 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
LMTK3Q96Q04 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
LMTK3Q96Q04 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
LMTK3Q96Q04 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
LMTK3Q96Q04 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms