Protein–RNA interactions for Protein: Q96KX2

CAPZA3, F-actin-capping protein subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPZA3Q96KX2 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CAPZA3Q96KX2 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
CAPZA3Q96KX2 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CAPZA3Q96KX2 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CAPZA3Q96KX2 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CAPZA3Q96KX2 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CAPZA3Q96KX2 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CAPZA3Q96KX2 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CAPZA3Q96KX2 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CAPZA3Q96KX2 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CAPZA3Q96KX2 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CAPZA3Q96KX2 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CAPZA3Q96KX2 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CAPZA3Q96KX2 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CAPZA3Q96KX2 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CAPZA3Q96KX2 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CAPZA3Q96KX2 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CAPZA3Q96KX2 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CAPZA3Q96KX2 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CAPZA3Q96KX2 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CAPZA3Q96KX2 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CAPZA3Q96KX2 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CAPZA3Q96KX2 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CAPZA3Q96KX2 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CAPZA3Q96KX2 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CAPZA3Q96KX2 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CAPZA3Q96KX2 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CAPZA3Q96KX2 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CAPZA3Q96KX2 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
CAPZA3Q96KX2 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CAPZA3Q96KX2 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CAPZA3Q96KX2 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CAPZA3Q96KX2 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
CAPZA3Q96KX2 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CAPZA3Q96KX2 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CAPZA3Q96KX2 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CAPZA3Q96KX2 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CAPZA3Q96KX2 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CAPZA3Q96KX2 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CAPZA3Q96KX2 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CAPZA3Q96KX2 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CAPZA3Q96KX2 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CAPZA3Q96KX2 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
CAPZA3Q96KX2 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
CAPZA3Q96KX2 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CAPZA3Q96KX2 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CAPZA3Q96KX2 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CAPZA3Q96KX2 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CAPZA3Q96KX2 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CAPZA3Q96KX2 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CAPZA3Q96KX2 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CAPZA3Q96KX2 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
CAPZA3Q96KX2 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CAPZA3Q96KX2 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CAPZA3Q96KX2 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CAPZA3Q96KX2 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CAPZA3Q96KX2 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CAPZA3Q96KX2 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CAPZA3Q96KX2 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CAPZA3Q96KX2 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CAPZA3Q96KX2 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CAPZA3Q96KX2 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CAPZA3Q96KX2 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CAPZA3Q96KX2 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CAPZA3Q96KX2 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
CAPZA3Q96KX2 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CAPZA3Q96KX2 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CAPZA3Q96KX2 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CAPZA3Q96KX2 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CAPZA3Q96KX2 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CAPZA3Q96KX2 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CAPZA3Q96KX2 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CAPZA3Q96KX2 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CAPZA3Q96KX2 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CAPZA3Q96KX2 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CAPZA3Q96KX2 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CAPZA3Q96KX2 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CAPZA3Q96KX2 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
CAPZA3Q96KX2 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CAPZA3Q96KX2 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CAPZA3Q96KX2 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CAPZA3Q96KX2 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CAPZA3Q96KX2 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CAPZA3Q96KX2 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CAPZA3Q96KX2 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
CAPZA3Q96KX2 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CAPZA3Q96KX2 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CAPZA3Q96KX2 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CAPZA3Q96KX2 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CAPZA3Q96KX2 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CAPZA3Q96KX2 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CAPZA3Q96KX2 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CAPZA3Q96KX2 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CAPZA3Q96KX2 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CAPZA3Q96KX2 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CAPZA3Q96KX2 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CAPZA3Q96KX2 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CAPZA3Q96KX2 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CAPZA3Q96KX2 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CAPZA3Q96KX2 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms