Protein–RNA interactions for Protein: Q96K76

USP47, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 47, humanhuman

Predictions only

Length 1,375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP47Q96K76 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
USP47Q96K76 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
USP47Q96K76 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
USP47Q96K76 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
USP47Q96K76 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
USP47Q96K76 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
USP47Q96K76 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
USP47Q96K76 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
USP47Q96K76 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
USP47Q96K76 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
USP47Q96K76 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
USP47Q96K76 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
USP47Q96K76 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
USP47Q96K76 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
USP47Q96K76 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
USP47Q96K76 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
USP47Q96K76 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
USP47Q96K76 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
USP47Q96K76 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
USP47Q96K76 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
USP47Q96K76 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
USP47Q96K76 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
USP47Q96K76 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
USP47Q96K76 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
USP47Q96K76 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
USP47Q96K76 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
USP47Q96K76 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
USP47Q96K76 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
USP47Q96K76 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
USP47Q96K76 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
USP47Q96K76 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
USP47Q96K76 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
USP47Q96K76 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
USP47Q96K76 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
USP47Q96K76 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
USP47Q96K76 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
USP47Q96K76 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
USP47Q96K76 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
USP47Q96K76 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
USP47Q96K76 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
USP47Q96K76 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
USP47Q96K76 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
USP47Q96K76 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
USP47Q96K76 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
USP47Q96K76 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
USP47Q96K76 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC26.92■■□□□ 1.9
USP47Q96K76 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
USP47Q96K76 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
USP47Q96K76 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
USP47Q96K76 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
USP47Q96K76 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
USP47Q96K76 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
USP47Q96K76 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
USP47Q96K76 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
USP47Q96K76 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
USP47Q96K76 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
USP47Q96K76 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
USP47Q96K76 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
USP47Q96K76 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
USP47Q96K76 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
USP47Q96K76 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
USP47Q96K76 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
USP47Q96K76 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
USP47Q96K76 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
USP47Q96K76 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
USP47Q96K76 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
USP47Q96K76 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
USP47Q96K76 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
USP47Q96K76 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
USP47Q96K76 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
USP47Q96K76 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
USP47Q96K76 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
USP47Q96K76 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
USP47Q96K76 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
USP47Q96K76 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
USP47Q96K76 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
USP47Q96K76 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
USP47Q96K76 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
USP47Q96K76 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
USP47Q96K76 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
USP47Q96K76 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
USP47Q96K76 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
USP47Q96K76 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
USP47Q96K76 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
USP47Q96K76 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
USP47Q96K76 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
USP47Q96K76 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
USP47Q96K76 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
USP47Q96K76 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
USP47Q96K76 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
USP47Q96K76 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
USP47Q96K76 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
USP47Q96K76 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
USP47Q96K76 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
USP47Q96K76 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
USP47Q96K76 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
USP47Q96K76 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
USP47Q96K76 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
USP47Q96K76 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
USP47Q96K76 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms