Protein–RNA interactions for Protein: Q96JQ0

DCHS1, Protocadherin-16, humanhuman

Predictions only

Length 3,298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCHS1Q96JQ0 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DCHS1Q96JQ0 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DCHS1Q96JQ0 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DCHS1Q96JQ0 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DCHS1Q96JQ0 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
DCHS1Q96JQ0 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DCHS1Q96JQ0 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DCHS1Q96JQ0 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DCHS1Q96JQ0 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DCHS1Q96JQ0 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DCHS1Q96JQ0 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DCHS1Q96JQ0 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DCHS1Q96JQ0 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DCHS1Q96JQ0 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DCHS1Q96JQ0 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DCHS1Q96JQ0 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DCHS1Q96JQ0 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DCHS1Q96JQ0 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
DCHS1Q96JQ0 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DCHS1Q96JQ0 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DCHS1Q96JQ0 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
DCHS1Q96JQ0 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DCHS1Q96JQ0 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DCHS1Q96JQ0 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DCHS1Q96JQ0 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DCHS1Q96JQ0 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DCHS1Q96JQ0 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DCHS1Q96JQ0 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DCHS1Q96JQ0 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DCHS1Q96JQ0 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DCHS1Q96JQ0 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DCHS1Q96JQ0 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DCHS1Q96JQ0 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DCHS1Q96JQ0 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DCHS1Q96JQ0 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
DCHS1Q96JQ0 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
DCHS1Q96JQ0 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DCHS1Q96JQ0 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DCHS1Q96JQ0 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DCHS1Q96JQ0 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DCHS1Q96JQ0 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DCHS1Q96JQ0 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DCHS1Q96JQ0 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DCHS1Q96JQ0 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DCHS1Q96JQ0 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DCHS1Q96JQ0 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DCHS1Q96JQ0 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
DCHS1Q96JQ0 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DCHS1Q96JQ0 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DCHS1Q96JQ0 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
DCHS1Q96JQ0 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DCHS1Q96JQ0 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DCHS1Q96JQ0 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DCHS1Q96JQ0 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DCHS1Q96JQ0 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DCHS1Q96JQ0 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DCHS1Q96JQ0 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DCHS1Q96JQ0 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DCHS1Q96JQ0 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DCHS1Q96JQ0 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DCHS1Q96JQ0 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DCHS1Q96JQ0 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DCHS1Q96JQ0 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DCHS1Q96JQ0 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DCHS1Q96JQ0 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DCHS1Q96JQ0 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DCHS1Q96JQ0 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DCHS1Q96JQ0 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
DCHS1Q96JQ0 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DCHS1Q96JQ0 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DCHS1Q96JQ0 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
DCHS1Q96JQ0 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
DCHS1Q96JQ0 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
DCHS1Q96JQ0 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
DCHS1Q96JQ0 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
DCHS1Q96JQ0 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
DCHS1Q96JQ0 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
DCHS1Q96JQ0 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
DCHS1Q96JQ0 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
DCHS1Q96JQ0 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
DCHS1Q96JQ0 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
DCHS1Q96JQ0 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
DCHS1Q96JQ0 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
DCHS1Q96JQ0 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
DCHS1Q96JQ0 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
DCHS1Q96JQ0 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
DCHS1Q96JQ0 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
DCHS1Q96JQ0 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
DCHS1Q96JQ0 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
DCHS1Q96JQ0 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
DCHS1Q96JQ0 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
DCHS1Q96JQ0 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
DCHS1Q96JQ0 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
DCHS1Q96JQ0 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
DCHS1Q96JQ0 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
DCHS1Q96JQ0 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
DCHS1Q96JQ0 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
DCHS1Q96JQ0 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
DCHS1Q96JQ0 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
DCHS1Q96JQ0 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms