Protein–RNA interactions for Protein: Q96J66

ABCC11, ATP-binding cassette sub-family C member 11, humanhuman

Predictions only

Length 1,382 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC11Q96J66 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ABCC11Q96J66 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
ABCC11Q96J66 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
ABCC11Q96J66 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ABCC11Q96J66 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ABCC11Q96J66 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ABCC11Q96J66 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ABCC11Q96J66 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
ABCC11Q96J66 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
ABCC11Q96J66 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
ABCC11Q96J66 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
ABCC11Q96J66 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ABCC11Q96J66 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
ABCC11Q96J66 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
ABCC11Q96J66 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ABCC11Q96J66 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ABCC11Q96J66 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ABCC11Q96J66 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
ABCC11Q96J66 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ABCC11Q96J66 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ABCC11Q96J66 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ABCC11Q96J66 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ABCC11Q96J66 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ABCC11Q96J66 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ABCC11Q96J66 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ABCC11Q96J66 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ABCC11Q96J66 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ABCC11Q96J66 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
ABCC11Q96J66 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
ABCC11Q96J66 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
ABCC11Q96J66 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
ABCC11Q96J66 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
ABCC11Q96J66 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
ABCC11Q96J66 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
ABCC11Q96J66 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
ABCC11Q96J66 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
ABCC11Q96J66 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
ABCC11Q96J66 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ABCC11Q96J66 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ABCC11Q96J66 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
ABCC11Q96J66 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
ABCC11Q96J66 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
ABCC11Q96J66 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
ABCC11Q96J66 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
ABCC11Q96J66 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ABCC11Q96J66 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ABCC11Q96J66 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ABCC11Q96J66 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
ABCC11Q96J66 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
ABCC11Q96J66 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
ABCC11Q96J66 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ABCC11Q96J66 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ABCC11Q96J66 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ABCC11Q96J66 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
ABCC11Q96J66 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ABCC11Q96J66 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
ABCC11Q96J66 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
ABCC11Q96J66 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
ABCC11Q96J66 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ABCC11Q96J66 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ABCC11Q96J66 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ABCC11Q96J66 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ABCC11Q96J66 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ABCC11Q96J66 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ABCC11Q96J66 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ABCC11Q96J66 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ABCC11Q96J66 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ABCC11Q96J66 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
ABCC11Q96J66 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
ABCC11Q96J66 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
ABCC11Q96J66 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
ABCC11Q96J66 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
ABCC11Q96J66 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ABCC11Q96J66 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
ABCC11Q96J66 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
ABCC11Q96J66 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ABCC11Q96J66 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ABCC11Q96J66 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
ABCC11Q96J66 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
ABCC11Q96J66 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
ABCC11Q96J66 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ABCC11Q96J66 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ABCC11Q96J66 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
ABCC11Q96J66 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC26.77■■□□□ 1.88
ABCC11Q96J66 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ABCC11Q96J66 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
ABCC11Q96J66 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
ABCC11Q96J66 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ABCC11Q96J66 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ABCC11Q96J66 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
ABCC11Q96J66 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
ABCC11Q96J66 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ABCC11Q96J66 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ABCC11Q96J66 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ABCC11Q96J66 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ABCC11Q96J66 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ABCC11Q96J66 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
ABCC11Q96J66 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
ABCC11Q96J66 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
ABCC11Q96J66 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms