Protein–RNA interactions for Protein: Q96A19

CCDC102A, Coiled-coil domain-containing protein 102A, humanhuman

Predictions only

Length 550 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC102AQ96A19 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC102AQ96A19 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC102AQ96A19 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC102AQ96A19 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC102AQ96A19 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC102AQ96A19 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC102AQ96A19 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC102AQ96A19 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC102AQ96A19 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC102AQ96A19 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC102AQ96A19 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC102AQ96A19 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC102AQ96A19 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC102AQ96A19 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC102AQ96A19 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC102AQ96A19 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC102AQ96A19 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC102AQ96A19 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC102AQ96A19 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC102AQ96A19 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC102AQ96A19 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC102AQ96A19 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC102AQ96A19 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC102AQ96A19 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC102AQ96A19 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC102AQ96A19 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC102AQ96A19 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC102AQ96A19 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC102AQ96A19 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC102AQ96A19 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC102AQ96A19 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC102AQ96A19 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC102AQ96A19 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC102AQ96A19 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC102AQ96A19 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC102AQ96A19 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC102AQ96A19 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC102AQ96A19 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC102AQ96A19 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC102AQ96A19 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC102AQ96A19 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC102AQ96A19 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC102AQ96A19 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC102AQ96A19 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC102AQ96A19 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC102AQ96A19 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC102AQ96A19 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC102AQ96A19 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC102AQ96A19 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC102AQ96A19 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC102AQ96A19 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC102AQ96A19 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC102AQ96A19 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC102AQ96A19 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC102AQ96A19 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC102AQ96A19 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC102AQ96A19 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC102AQ96A19 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC102AQ96A19 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC102AQ96A19 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC102AQ96A19 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC102AQ96A19 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC102AQ96A19 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC102AQ96A19 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC102AQ96A19 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC102AQ96A19 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC102AQ96A19 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC102AQ96A19 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC102AQ96A19 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC102AQ96A19 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC102AQ96A19 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC102AQ96A19 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
CCDC102AQ96A19 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
CCDC102AQ96A19 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC22.77■■□□□ 1.23
CCDC102AQ96A19 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC102AQ96A19 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC102AQ96A19 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC102AQ96A19 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC102AQ96A19 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC102AQ96A19 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC102AQ96A19 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC102AQ96A19 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC102AQ96A19 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC102AQ96A19 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC102AQ96A19 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC102AQ96A19 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC102AQ96A19 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC102AQ96A19 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC102AQ96A19 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC102AQ96A19 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC102AQ96A19 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC102AQ96A19 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC102AQ96A19 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC102AQ96A19 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC102AQ96A19 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC102AQ96A19 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC102AQ96A19 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC102AQ96A19 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC102AQ96A19 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC102AQ96A19 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms