Protein–RNA interactions for Protein: Q969E8

TSR2, Pre-rRNA-processing protein TSR2 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 191 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSR2Q969E8 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TSR2Q969E8 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TSR2Q969E8 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TSR2Q969E8 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TSR2Q969E8 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TSR2Q969E8 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TSR2Q969E8 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TSR2Q969E8 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TSR2Q969E8 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TSR2Q969E8 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TSR2Q969E8 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TSR2Q969E8 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TSR2Q969E8 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TSR2Q969E8 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TSR2Q969E8 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TSR2Q969E8 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TSR2Q969E8 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TSR2Q969E8 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TSR2Q969E8 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TSR2Q969E8 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TSR2Q969E8 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TSR2Q969E8 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TSR2Q969E8 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
TSR2Q969E8 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TSR2Q969E8 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TSR2Q969E8 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TSR2Q969E8 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TSR2Q969E8 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
TSR2Q969E8 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TSR2Q969E8 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TSR2Q969E8 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TSR2Q969E8 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TSR2Q969E8 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TSR2Q969E8 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TSR2Q969E8 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TSR2Q969E8 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TSR2Q969E8 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TSR2Q969E8 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TSR2Q969E8 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TSR2Q969E8 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TSR2Q969E8 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
TSR2Q969E8 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
TSR2Q969E8 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TSR2Q969E8 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TSR2Q969E8 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TSR2Q969E8 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TSR2Q969E8 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
TSR2Q969E8 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TSR2Q969E8 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TSR2Q969E8 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TSR2Q969E8 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
TSR2Q969E8 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TSR2Q969E8 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TSR2Q969E8 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TSR2Q969E8 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TSR2Q969E8 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
TSR2Q969E8 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TSR2Q969E8 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TSR2Q969E8 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TSR2Q969E8 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TSR2Q969E8 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TSR2Q969E8 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TSR2Q969E8 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TSR2Q969E8 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TSR2Q969E8 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TSR2Q969E8 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TSR2Q969E8 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TSR2Q969E8 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TSR2Q969E8 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TSR2Q969E8 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TSR2Q969E8 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TSR2Q969E8 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TSR2Q969E8 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TSR2Q969E8 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TSR2Q969E8 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TSR2Q969E8 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TSR2Q969E8 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TSR2Q969E8 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TSR2Q969E8 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TSR2Q969E8 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TSR2Q969E8 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TSR2Q969E8 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TSR2Q969E8 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TSR2Q969E8 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TSR2Q969E8 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
TSR2Q969E8 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
TSR2Q969E8 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
TSR2Q969E8 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
TSR2Q969E8 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
TSR2Q969E8 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
TSR2Q969E8 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
TSR2Q969E8 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TSR2Q969E8 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TSR2Q969E8 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TSR2Q969E8 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
TSR2Q969E8 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TSR2Q969E8 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TSR2Q969E8 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TSR2Q969E8 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TSR2Q969E8 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.8 ms