Protein–RNA interactions for Protein: Q92576

PHF3, PHD finger protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,039 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF3Q92576 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
PHF3Q92576 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PHF3Q92576 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PHF3Q92576 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PHF3Q92576 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PHF3Q92576 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PHF3Q92576 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PHF3Q92576 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PHF3Q92576 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
PHF3Q92576 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
PHF3Q92576 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PHF3Q92576 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PHF3Q92576 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PHF3Q92576 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PHF3Q92576 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PHF3Q92576 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PHF3Q92576 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PHF3Q92576 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PHF3Q92576 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
PHF3Q92576 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PHF3Q92576 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PHF3Q92576 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
PHF3Q92576 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
PHF3Q92576 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
PHF3Q92576 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.37
PHF3Q92576 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PHF3Q92576 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
PHF3Q92576 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.37
PHF3Q92576 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
PHF3Q92576 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PHF3Q92576 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
PHF3Q92576 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PHF3Q92576 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PHF3Q92576 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PHF3Q92576 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PHF3Q92576 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
PHF3Q92576 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PHF3Q92576 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PHF3Q92576 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
PHF3Q92576 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PHF3Q92576 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PHF3Q92576 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PHF3Q92576 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PHF3Q92576 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PHF3Q92576 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PHF3Q92576 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PHF3Q92576 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PHF3Q92576 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PHF3Q92576 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PHF3Q92576 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PHF3Q92576 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PHF3Q92576 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PHF3Q92576 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PHF3Q92576 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
PHF3Q92576 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
PHF3Q92576 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PHF3Q92576 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PHF3Q92576 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PHF3Q92576 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PHF3Q92576 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PHF3Q92576 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PHF3Q92576 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PHF3Q92576 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PHF3Q92576 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PHF3Q92576 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PHF3Q92576 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PHF3Q92576 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PHF3Q92576 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PHF3Q92576 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
PHF3Q92576 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PHF3Q92576 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PHF3Q92576 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PHF3Q92576 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PHF3Q92576 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PHF3Q92576 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PHF3Q92576 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PHF3Q92576 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PHF3Q92576 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PHF3Q92576 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PHF3Q92576 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PHF3Q92576 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PHF3Q92576 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
PHF3Q92576 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PHF3Q92576 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
PHF3Q92576 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PHF3Q92576 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PHF3Q92576 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PHF3Q92576 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PHF3Q92576 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PHF3Q92576 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PHF3Q92576 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PHF3Q92576 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PHF3Q92576 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PHF3Q92576 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PHF3Q92576 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PHF3Q92576 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PHF3Q92576 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PHF3Q92576 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PHF3Q92576 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PHF3Q92576 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms