Protein–RNA interactions for Protein: Q92570

NR4A3, Nuclear receptor subfamily 4 group A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 626 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR4A3Q92570 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NR4A3Q92570 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NR4A3Q92570 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NR4A3Q92570 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NR4A3Q92570 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NR4A3Q92570 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NR4A3Q92570 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NR4A3Q92570 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NR4A3Q92570 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NR4A3Q92570 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NR4A3Q92570 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NR4A3Q92570 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
NR4A3Q92570 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NR4A3Q92570 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NR4A3Q92570 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NR4A3Q92570 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NR4A3Q92570 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NR4A3Q92570 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
NR4A3Q92570 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NR4A3Q92570 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
NR4A3Q92570 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NR4A3Q92570 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
NR4A3Q92570 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NR4A3Q92570 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NR4A3Q92570 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NR4A3Q92570 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NR4A3Q92570 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NR4A3Q92570 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NR4A3Q92570 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NR4A3Q92570 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NR4A3Q92570 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NR4A3Q92570 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NR4A3Q92570 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NR4A3Q92570 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NR4A3Q92570 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NR4A3Q92570 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
NR4A3Q92570 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
NR4A3Q92570 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NR4A3Q92570 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NR4A3Q92570 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NR4A3Q92570 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NR4A3Q92570 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NR4A3Q92570 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NR4A3Q92570 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NR4A3Q92570 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NR4A3Q92570 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
NR4A3Q92570 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NR4A3Q92570 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NR4A3Q92570 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NR4A3Q92570 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NR4A3Q92570 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NR4A3Q92570 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NR4A3Q92570 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
NR4A3Q92570 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
NR4A3Q92570 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
NR4A3Q92570 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
NR4A3Q92570 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NR4A3Q92570 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NR4A3Q92570 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NR4A3Q92570 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NR4A3Q92570 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NR4A3Q92570 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NR4A3Q92570 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NR4A3Q92570 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NR4A3Q92570 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NR4A3Q92570 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NR4A3Q92570 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NR4A3Q92570 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NR4A3Q92570 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NR4A3Q92570 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NR4A3Q92570 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NR4A3Q92570 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NR4A3Q92570 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NR4A3Q92570 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NR4A3Q92570 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NR4A3Q92570 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NR4A3Q92570 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NR4A3Q92570 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NR4A3Q92570 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NR4A3Q92570 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NR4A3Q92570 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NR4A3Q92570 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NR4A3Q92570 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NR4A3Q92570 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NR4A3Q92570 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NR4A3Q92570 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NR4A3Q92570 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NR4A3Q92570 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NR4A3Q92570 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NR4A3Q92570 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
NR4A3Q92570 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NR4A3Q92570 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NR4A3Q92570 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NR4A3Q92570 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NR4A3Q92570 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NR4A3Q92570 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NR4A3Q92570 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NR4A3Q92570 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NR4A3Q92570 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
NR4A3Q92570 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms