Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXU2

DNAAF4, Dynein assembly factor 4, axonemal, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAAF4Q8WXU2 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
DNAAF4Q8WXU2 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
DNAAF4Q8WXU2 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
DNAAF4Q8WXU2 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
DNAAF4Q8WXU2 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
DNAAF4Q8WXU2 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
DNAAF4Q8WXU2 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
DNAAF4Q8WXU2 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
DNAAF4Q8WXU2 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
DNAAF4Q8WXU2 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
DNAAF4Q8WXU2 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
DNAAF4Q8WXU2 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
DNAAF4Q8WXU2 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
DNAAF4Q8WXU2 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
DNAAF4Q8WXU2 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
DNAAF4Q8WXU2 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
DNAAF4Q8WXU2 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
DNAAF4Q8WXU2 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
DNAAF4Q8WXU2 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
DNAAF4Q8WXU2 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
DNAAF4Q8WXU2 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
DNAAF4Q8WXU2 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
DNAAF4Q8WXU2 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
DNAAF4Q8WXU2 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
DNAAF4Q8WXU2 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
DNAAF4Q8WXU2 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
DNAAF4Q8WXU2 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
DNAAF4Q8WXU2 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
DNAAF4Q8WXU2 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
DNAAF4Q8WXU2 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
DNAAF4Q8WXU2 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
DNAAF4Q8WXU2 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
DNAAF4Q8WXU2 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
DNAAF4Q8WXU2 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
DNAAF4Q8WXU2 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
DNAAF4Q8WXU2 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
DNAAF4Q8WXU2 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
DNAAF4Q8WXU2 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
DNAAF4Q8WXU2 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
DNAAF4Q8WXU2 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
DNAAF4Q8WXU2 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
DNAAF4Q8WXU2 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
DNAAF4Q8WXU2 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
DNAAF4Q8WXU2 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
DNAAF4Q8WXU2 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
DNAAF4Q8WXU2 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
DNAAF4Q8WXU2 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
DNAAF4Q8WXU2 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
DNAAF4Q8WXU2 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
DNAAF4Q8WXU2 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
DNAAF4Q8WXU2 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
DNAAF4Q8WXU2 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
DNAAF4Q8WXU2 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
DNAAF4Q8WXU2 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
DNAAF4Q8WXU2 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
DNAAF4Q8WXU2 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
DNAAF4Q8WXU2 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
DNAAF4Q8WXU2 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
DNAAF4Q8WXU2 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
DNAAF4Q8WXU2 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
DNAAF4Q8WXU2 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
DNAAF4Q8WXU2 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
DNAAF4Q8WXU2 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
DNAAF4Q8WXU2 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
DNAAF4Q8WXU2 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
DNAAF4Q8WXU2 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
DNAAF4Q8WXU2 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
DNAAF4Q8WXU2 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
DNAAF4Q8WXU2 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
DNAAF4Q8WXU2 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
DNAAF4Q8WXU2 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
DNAAF4Q8WXU2 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
DNAAF4Q8WXU2 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
DNAAF4Q8WXU2 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
DNAAF4Q8WXU2 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
DNAAF4Q8WXU2 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
DNAAF4Q8WXU2 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
DNAAF4Q8WXU2 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
DNAAF4Q8WXU2 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
DNAAF4Q8WXU2 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
DNAAF4Q8WXU2 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
DNAAF4Q8WXU2 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
DNAAF4Q8WXU2 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
DNAAF4Q8WXU2 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
DNAAF4Q8WXU2 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
DNAAF4Q8WXU2 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
DNAAF4Q8WXU2 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
DNAAF4Q8WXU2 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
DNAAF4Q8WXU2 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
DNAAF4Q8WXU2 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
DNAAF4Q8WXU2 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
DNAAF4Q8WXU2 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
DNAAF4Q8WXU2 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
DNAAF4Q8WXU2 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
DNAAF4Q8WXU2 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
DNAAF4Q8WXU2 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
DNAAF4Q8WXU2 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
DNAAF4Q8WXU2 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
DNAAF4Q8WXU2 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
DNAAF4Q8WXU2 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms