Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFU0

BEST4, Bestrophin-4, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEST4Q8NFU0 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
BEST4Q8NFU0 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
BEST4Q8NFU0 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
BEST4Q8NFU0 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
BEST4Q8NFU0 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
BEST4Q8NFU0 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
BEST4Q8NFU0 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
BEST4Q8NFU0 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
BEST4Q8NFU0 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
BEST4Q8NFU0 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
BEST4Q8NFU0 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
BEST4Q8NFU0 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
BEST4Q8NFU0 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.25
BEST4Q8NFU0 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
BEST4Q8NFU0 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
BEST4Q8NFU0 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
BEST4Q8NFU0 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
BEST4Q8NFU0 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
BEST4Q8NFU0 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
BEST4Q8NFU0 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
BEST4Q8NFU0 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
BEST4Q8NFU0 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
BEST4Q8NFU0 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
BEST4Q8NFU0 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
BEST4Q8NFU0 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
BEST4Q8NFU0 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
BEST4Q8NFU0 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
BEST4Q8NFU0 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
BEST4Q8NFU0 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
BEST4Q8NFU0 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
BEST4Q8NFU0 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
BEST4Q8NFU0 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
BEST4Q8NFU0 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
BEST4Q8NFU0 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
BEST4Q8NFU0 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
BEST4Q8NFU0 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
BEST4Q8NFU0 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
BEST4Q8NFU0 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
BEST4Q8NFU0 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
BEST4Q8NFU0 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
BEST4Q8NFU0 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
BEST4Q8NFU0 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
BEST4Q8NFU0 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
BEST4Q8NFU0 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
BEST4Q8NFU0 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
BEST4Q8NFU0 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
BEST4Q8NFU0 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
BEST4Q8NFU0 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
BEST4Q8NFU0 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
BEST4Q8NFU0 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
BEST4Q8NFU0 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
BEST4Q8NFU0 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
BEST4Q8NFU0 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
BEST4Q8NFU0 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
BEST4Q8NFU0 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
BEST4Q8NFU0 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
BEST4Q8NFU0 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
BEST4Q8NFU0 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
BEST4Q8NFU0 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
BEST4Q8NFU0 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
BEST4Q8NFU0 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
BEST4Q8NFU0 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
BEST4Q8NFU0 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
BEST4Q8NFU0 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
BEST4Q8NFU0 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
BEST4Q8NFU0 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
BEST4Q8NFU0 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
BEST4Q8NFU0 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
BEST4Q8NFU0 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
BEST4Q8NFU0 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
BEST4Q8NFU0 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
BEST4Q8NFU0 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
BEST4Q8NFU0 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
BEST4Q8NFU0 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
BEST4Q8NFU0 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
BEST4Q8NFU0 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
BEST4Q8NFU0 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
BEST4Q8NFU0 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
BEST4Q8NFU0 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
BEST4Q8NFU0 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
BEST4Q8NFU0 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
BEST4Q8NFU0 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
BEST4Q8NFU0 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
BEST4Q8NFU0 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
BEST4Q8NFU0 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
BEST4Q8NFU0 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
BEST4Q8NFU0 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
BEST4Q8NFU0 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
BEST4Q8NFU0 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
BEST4Q8NFU0 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
BEST4Q8NFU0 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
BEST4Q8NFU0 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
BEST4Q8NFU0 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
BEST4Q8NFU0 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
BEST4Q8NFU0 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
BEST4Q8NFU0 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
BEST4Q8NFU0 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
BEST4Q8NFU0 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
BEST4Q8NFU0 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
BEST4Q8NFU0 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms