Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9V6

ANKRD53, Ankyrin repeat domain-containing protein 53, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD53Q8N9V6 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ANKRD53Q8N9V6 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ANKRD53Q8N9V6 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ANKRD53Q8N9V6 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ANKRD53Q8N9V6 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
ANKRD53Q8N9V6 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ANKRD53Q8N9V6 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
ANKRD53Q8N9V6 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ANKRD53Q8N9V6 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ANKRD53Q8N9V6 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ANKRD53Q8N9V6 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ANKRD53Q8N9V6 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ANKRD53Q8N9V6 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ANKRD53Q8N9V6 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ANKRD53Q8N9V6 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ANKRD53Q8N9V6 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ANKRD53Q8N9V6 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
ANKRD53Q8N9V6 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
ANKRD53Q8N9V6 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
ANKRD53Q8N9V6 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ANKRD53Q8N9V6 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ANKRD53Q8N9V6 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ANKRD53Q8N9V6 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ANKRD53Q8N9V6 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ANKRD53Q8N9V6 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ANKRD53Q8N9V6 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ANKRD53Q8N9V6 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ANKRD53Q8N9V6 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ANKRD53Q8N9V6 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ANKRD53Q8N9V6 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ANKRD53Q8N9V6 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ANKRD53Q8N9V6 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ANKRD53Q8N9V6 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ANKRD53Q8N9V6 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ANKRD53Q8N9V6 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ANKRD53Q8N9V6 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
ANKRD53Q8N9V6 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
ANKRD53Q8N9V6 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ANKRD53Q8N9V6 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ANKRD53Q8N9V6 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ANKRD53Q8N9V6 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ANKRD53Q8N9V6 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ANKRD53Q8N9V6 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ANKRD53Q8N9V6 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ANKRD53Q8N9V6 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ANKRD53Q8N9V6 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ANKRD53Q8N9V6 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ANKRD53Q8N9V6 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ANKRD53Q8N9V6 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ANKRD53Q8N9V6 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ANKRD53Q8N9V6 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ANKRD53Q8N9V6 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ANKRD53Q8N9V6 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ANKRD53Q8N9V6 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ANKRD53Q8N9V6 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ANKRD53Q8N9V6 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ANKRD53Q8N9V6 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ANKRD53Q8N9V6 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ANKRD53Q8N9V6 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ANKRD53Q8N9V6 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ANKRD53Q8N9V6 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ANKRD53Q8N9V6 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ANKRD53Q8N9V6 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ANKRD53Q8N9V6 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ANKRD53Q8N9V6 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ANKRD53Q8N9V6 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ANKRD53Q8N9V6 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ANKRD53Q8N9V6 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ANKRD53Q8N9V6 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ANKRD53Q8N9V6 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ANKRD53Q8N9V6 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ANKRD53Q8N9V6 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ANKRD53Q8N9V6 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ANKRD53Q8N9V6 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ANKRD53Q8N9V6 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ANKRD53Q8N9V6 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ANKRD53Q8N9V6 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ANKRD53Q8N9V6 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ANKRD53Q8N9V6 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ANKRD53Q8N9V6 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ANKRD53Q8N9V6 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ANKRD53Q8N9V6 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ANKRD53Q8N9V6 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ANKRD53Q8N9V6 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ANKRD53Q8N9V6 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ANKRD53Q8N9V6 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ANKRD53Q8N9V6 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ANKRD53Q8N9V6 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ANKRD53Q8N9V6 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ANKRD53Q8N9V6 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ANKRD53Q8N9V6 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ANKRD53Q8N9V6 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ANKRD53Q8N9V6 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ANKRD53Q8N9V6 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ANKRD53Q8N9V6 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ANKRD53Q8N9V6 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
ANKRD53Q8N9V6 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ANKRD53Q8N9V6 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ANKRD53Q8N9V6 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
ANKRD53Q8N9V6 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.5 ms