Protein–RNA interactions for Protein: Q8N271

PROM2, Prominin-2, humanhuman

Predictions only

Length 834 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PROM2Q8N271 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PROM2Q8N271 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PROM2Q8N271 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
PROM2Q8N271 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PROM2Q8N271 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PROM2Q8N271 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PROM2Q8N271 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PROM2Q8N271 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PROM2Q8N271 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PROM2Q8N271 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PROM2Q8N271 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PROM2Q8N271 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PROM2Q8N271 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PROM2Q8N271 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PROM2Q8N271 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PROM2Q8N271 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PROM2Q8N271 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PROM2Q8N271 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PROM2Q8N271 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
PROM2Q8N271 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PROM2Q8N271 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PROM2Q8N271 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PROM2Q8N271 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
PROM2Q8N271 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PROM2Q8N271 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PROM2Q8N271 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PROM2Q8N271 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PROM2Q8N271 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PROM2Q8N271 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PROM2Q8N271 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PROM2Q8N271 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PROM2Q8N271 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PROM2Q8N271 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PROM2Q8N271 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PROM2Q8N271 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PROM2Q8N271 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PROM2Q8N271 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PROM2Q8N271 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PROM2Q8N271 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
PROM2Q8N271 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PROM2Q8N271 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
PROM2Q8N271 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PROM2Q8N271 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PROM2Q8N271 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PROM2Q8N271 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PROM2Q8N271 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
PROM2Q8N271 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PROM2Q8N271 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PROM2Q8N271 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
PROM2Q8N271 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PROM2Q8N271 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PROM2Q8N271 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PROM2Q8N271 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PROM2Q8N271 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PROM2Q8N271 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PROM2Q8N271 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PROM2Q8N271 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PROM2Q8N271 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PROM2Q8N271 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PROM2Q8N271 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PROM2Q8N271 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PROM2Q8N271 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PROM2Q8N271 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PROM2Q8N271 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PROM2Q8N271 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PROM2Q8N271 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PROM2Q8N271 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PROM2Q8N271 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PROM2Q8N271 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
PROM2Q8N271 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PROM2Q8N271 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PROM2Q8N271 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PROM2Q8N271 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PROM2Q8N271 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PROM2Q8N271 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PROM2Q8N271 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PROM2Q8N271 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PROM2Q8N271 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PROM2Q8N271 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
PROM2Q8N271 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PROM2Q8N271 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PROM2Q8N271 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PROM2Q8N271 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PROM2Q8N271 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PROM2Q8N271 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PROM2Q8N271 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PROM2Q8N271 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PROM2Q8N271 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PROM2Q8N271 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PROM2Q8N271 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PROM2Q8N271 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PROM2Q8N271 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PROM2Q8N271 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PROM2Q8N271 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PROM2Q8N271 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PROM2Q8N271 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
PROM2Q8N271 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PROM2Q8N271 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PROM2Q8N271 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PROM2Q8N271 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms