Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWD4

CCDC117, Coiled-coil domain-containing protein 117, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC117Q8IWD4 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC117Q8IWD4 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC117Q8IWD4 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC117Q8IWD4 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC117Q8IWD4 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC117Q8IWD4 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC117Q8IWD4 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC117Q8IWD4 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC117Q8IWD4 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC117Q8IWD4 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC117Q8IWD4 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC117Q8IWD4 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC117Q8IWD4 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC117Q8IWD4 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC117Q8IWD4 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC117Q8IWD4 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC117Q8IWD4 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC117Q8IWD4 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC117Q8IWD4 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC117Q8IWD4 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC117Q8IWD4 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC117Q8IWD4 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC117Q8IWD4 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC117Q8IWD4 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC117Q8IWD4 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC117Q8IWD4 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC117Q8IWD4 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC117Q8IWD4 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC117Q8IWD4 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC117Q8IWD4 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC117Q8IWD4 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC117Q8IWD4 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC117Q8IWD4 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC117Q8IWD4 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC117Q8IWD4 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC117Q8IWD4 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC117Q8IWD4 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC117Q8IWD4 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC117Q8IWD4 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC117Q8IWD4 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC117Q8IWD4 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC117Q8IWD4 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC117Q8IWD4 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC117Q8IWD4 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC117Q8IWD4 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC117Q8IWD4 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC117Q8IWD4 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC117Q8IWD4 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC117Q8IWD4 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC117Q8IWD4 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC117Q8IWD4 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC117Q8IWD4 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC117Q8IWD4 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC117Q8IWD4 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC117Q8IWD4 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC117Q8IWD4 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC117Q8IWD4 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC117Q8IWD4 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC117Q8IWD4 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC117Q8IWD4 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC117Q8IWD4 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC117Q8IWD4 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC117Q8IWD4 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC117Q8IWD4 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC117Q8IWD4 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC117Q8IWD4 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC117Q8IWD4 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC117Q8IWD4 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC117Q8IWD4 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC117Q8IWD4 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC117Q8IWD4 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC117Q8IWD4 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC117Q8IWD4 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC117Q8IWD4 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC117Q8IWD4 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC117Q8IWD4 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC117Q8IWD4 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC117Q8IWD4 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC117Q8IWD4 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC117Q8IWD4 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC117Q8IWD4 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC117Q8IWD4 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC117Q8IWD4 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC117Q8IWD4 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.79
CCDC117Q8IWD4 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.79
CCDC117Q8IWD4 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC117Q8IWD4 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC117Q8IWD4 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC117Q8IWD4 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC117Q8IWD4 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC117Q8IWD4 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC117Q8IWD4 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC117Q8IWD4 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC117Q8IWD4 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC117Q8IWD4 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC117Q8IWD4 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC117Q8IWD4 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC117Q8IWD4 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC117Q8IWD4 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC117Q8IWD4 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms