Protein–RNA interactions for Protein: Q86YR7

MCF2L2, Probable guanine nucleotide exchange factor MCF2L2, humanhuman

Predictions only

Length 1,114 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCF2L2Q86YR7 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MCF2L2Q86YR7 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
MCF2L2Q86YR7 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MCF2L2Q86YR7 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
MCF2L2Q86YR7 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
MCF2L2Q86YR7 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
MCF2L2Q86YR7 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MCF2L2Q86YR7 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
MCF2L2Q86YR7 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MCF2L2Q86YR7 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MCF2L2Q86YR7 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MCF2L2Q86YR7 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MCF2L2Q86YR7 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
MCF2L2Q86YR7 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
MCF2L2Q86YR7 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
MCF2L2Q86YR7 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
MCF2L2Q86YR7 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MCF2L2Q86YR7 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
MCF2L2Q86YR7 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MCF2L2Q86YR7 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MCF2L2Q86YR7 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MCF2L2Q86YR7 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MCF2L2Q86YR7 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
MCF2L2Q86YR7 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
MCF2L2Q86YR7 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MCF2L2Q86YR7 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
MCF2L2Q86YR7 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
MCF2L2Q86YR7 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
MCF2L2Q86YR7 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
MCF2L2Q86YR7 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MCF2L2Q86YR7 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MCF2L2Q86YR7 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MCF2L2Q86YR7 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MCF2L2Q86YR7 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MCF2L2Q86YR7 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MCF2L2Q86YR7 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
MCF2L2Q86YR7 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MCF2L2Q86YR7 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
MCF2L2Q86YR7 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MCF2L2Q86YR7 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MCF2L2Q86YR7 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
MCF2L2Q86YR7 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
MCF2L2Q86YR7 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MCF2L2Q86YR7 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MCF2L2Q86YR7 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
MCF2L2Q86YR7 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MCF2L2Q86YR7 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MCF2L2Q86YR7 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
MCF2L2Q86YR7 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MCF2L2Q86YR7 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MCF2L2Q86YR7 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MCF2L2Q86YR7 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
MCF2L2Q86YR7 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
MCF2L2Q86YR7 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MCF2L2Q86YR7 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
MCF2L2Q86YR7 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
MCF2L2Q86YR7 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
MCF2L2Q86YR7 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MCF2L2Q86YR7 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
MCF2L2Q86YR7 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
MCF2L2Q86YR7 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MCF2L2Q86YR7 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MCF2L2Q86YR7 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MCF2L2Q86YR7 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
MCF2L2Q86YR7 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MCF2L2Q86YR7 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MCF2L2Q86YR7 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MCF2L2Q86YR7 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
MCF2L2Q86YR7 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MCF2L2Q86YR7 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
MCF2L2Q86YR7 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MCF2L2Q86YR7 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MCF2L2Q86YR7 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MCF2L2Q86YR7 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
MCF2L2Q86YR7 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MCF2L2Q86YR7 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MCF2L2Q86YR7 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
MCF2L2Q86YR7 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
MCF2L2Q86YR7 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
MCF2L2Q86YR7 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
MCF2L2Q86YR7 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
MCF2L2Q86YR7 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
MCF2L2Q86YR7 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MCF2L2Q86YR7 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MCF2L2Q86YR7 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
MCF2L2Q86YR7 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MCF2L2Q86YR7 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MCF2L2Q86YR7 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MCF2L2Q86YR7 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
MCF2L2Q86YR7 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MCF2L2Q86YR7 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MCF2L2Q86YR7 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MCF2L2Q86YR7 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
MCF2L2Q86YR7 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MCF2L2Q86YR7 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
MCF2L2Q86YR7 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MCF2L2Q86YR7 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
MCF2L2Q86YR7 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
MCF2L2Q86YR7 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MCF2L2Q86YR7 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms