Protein–RNA interactions for Protein: Q86XT2

VPS37D, Vacuolar protein sorting-associated protein 37D, humanhuman

Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS37DQ86XT2 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
VPS37DQ86XT2 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
VPS37DQ86XT2 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
VPS37DQ86XT2 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
VPS37DQ86XT2 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
VPS37DQ86XT2 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
VPS37DQ86XT2 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
VPS37DQ86XT2 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
VPS37DQ86XT2 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
VPS37DQ86XT2 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
VPS37DQ86XT2 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
VPS37DQ86XT2 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
VPS37DQ86XT2 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
VPS37DQ86XT2 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
VPS37DQ86XT2 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
VPS37DQ86XT2 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
VPS37DQ86XT2 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
VPS37DQ86XT2 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
VPS37DQ86XT2 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
VPS37DQ86XT2 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
VPS37DQ86XT2 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
VPS37DQ86XT2 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
VPS37DQ86XT2 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
VPS37DQ86XT2 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
VPS37DQ86XT2 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
VPS37DQ86XT2 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
VPS37DQ86XT2 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
VPS37DQ86XT2 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
VPS37DQ86XT2 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
VPS37DQ86XT2 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
VPS37DQ86XT2 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
VPS37DQ86XT2 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
VPS37DQ86XT2 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
VPS37DQ86XT2 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
VPS37DQ86XT2 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
VPS37DQ86XT2 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
VPS37DQ86XT2 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
VPS37DQ86XT2 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
VPS37DQ86XT2 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
VPS37DQ86XT2 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
VPS37DQ86XT2 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
VPS37DQ86XT2 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
VPS37DQ86XT2 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
VPS37DQ86XT2 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
VPS37DQ86XT2 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
VPS37DQ86XT2 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
VPS37DQ86XT2 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
VPS37DQ86XT2 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
VPS37DQ86XT2 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
VPS37DQ86XT2 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
VPS37DQ86XT2 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
VPS37DQ86XT2 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
VPS37DQ86XT2 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
VPS37DQ86XT2 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
VPS37DQ86XT2 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
VPS37DQ86XT2 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
VPS37DQ86XT2 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
VPS37DQ86XT2 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
VPS37DQ86XT2 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
VPS37DQ86XT2 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
VPS37DQ86XT2 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
VPS37DQ86XT2 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
VPS37DQ86XT2 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
VPS37DQ86XT2 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
VPS37DQ86XT2 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
VPS37DQ86XT2 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
VPS37DQ86XT2 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
VPS37DQ86XT2 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
VPS37DQ86XT2 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
VPS37DQ86XT2 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
VPS37DQ86XT2 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
VPS37DQ86XT2 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
VPS37DQ86XT2 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
VPS37DQ86XT2 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
VPS37DQ86XT2 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
VPS37DQ86XT2 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
VPS37DQ86XT2 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
VPS37DQ86XT2 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
VPS37DQ86XT2 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
VPS37DQ86XT2 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
VPS37DQ86XT2 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
VPS37DQ86XT2 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
VPS37DQ86XT2 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
VPS37DQ86XT2 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
VPS37DQ86XT2 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
VPS37DQ86XT2 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
VPS37DQ86XT2 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
VPS37DQ86XT2 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
VPS37DQ86XT2 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
VPS37DQ86XT2 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
VPS37DQ86XT2 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
VPS37DQ86XT2 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
VPS37DQ86XT2 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
VPS37DQ86XT2 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
VPS37DQ86XT2 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
VPS37DQ86XT2 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
VPS37DQ86XT2 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
VPS37DQ86XT2 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
VPS37DQ86XT2 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
VPS37DQ86XT2 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms