Protein–RNA interactions for Protein: Q86VQ6

TXNRD3, Thioredoxin reductase 3, humanhuman

Predictions only

Length 643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TXNRD3Q86VQ6 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TXNRD3Q86VQ6 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TXNRD3Q86VQ6 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TXNRD3Q86VQ6 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TXNRD3Q86VQ6 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TXNRD3Q86VQ6 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TXNRD3Q86VQ6 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TXNRD3Q86VQ6 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TXNRD3Q86VQ6 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TXNRD3Q86VQ6 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TXNRD3Q86VQ6 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TXNRD3Q86VQ6 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TXNRD3Q86VQ6 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TXNRD3Q86VQ6 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TXNRD3Q86VQ6 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
TXNRD3Q86VQ6 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TXNRD3Q86VQ6 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TXNRD3Q86VQ6 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TXNRD3Q86VQ6 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TXNRD3Q86VQ6 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TXNRD3Q86VQ6 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TXNRD3Q86VQ6 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TXNRD3Q86VQ6 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TXNRD3Q86VQ6 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TXNRD3Q86VQ6 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TXNRD3Q86VQ6 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TXNRD3Q86VQ6 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TXNRD3Q86VQ6 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TXNRD3Q86VQ6 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
TXNRD3Q86VQ6 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
TXNRD3Q86VQ6 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TXNRD3Q86VQ6 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TXNRD3Q86VQ6 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TXNRD3Q86VQ6 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
TXNRD3Q86VQ6 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TXNRD3Q86VQ6 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TXNRD3Q86VQ6 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TXNRD3Q86VQ6 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TXNRD3Q86VQ6 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TXNRD3Q86VQ6 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TXNRD3Q86VQ6 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TXNRD3Q86VQ6 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TXNRD3Q86VQ6 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TXNRD3Q86VQ6 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TXNRD3Q86VQ6 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TXNRD3Q86VQ6 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TXNRD3Q86VQ6 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TXNRD3Q86VQ6 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TXNRD3Q86VQ6 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TXNRD3Q86VQ6 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
TXNRD3Q86VQ6 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TXNRD3Q86VQ6 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TXNRD3Q86VQ6 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TXNRD3Q86VQ6 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TXNRD3Q86VQ6 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TXNRD3Q86VQ6 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
TXNRD3Q86VQ6 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TXNRD3Q86VQ6 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TXNRD3Q86VQ6 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TXNRD3Q86VQ6 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TXNRD3Q86VQ6 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TXNRD3Q86VQ6 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TXNRD3Q86VQ6 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TXNRD3Q86VQ6 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TXNRD3Q86VQ6 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TXNRD3Q86VQ6 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TXNRD3Q86VQ6 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TXNRD3Q86VQ6 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TXNRD3Q86VQ6 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TXNRD3Q86VQ6 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TXNRD3Q86VQ6 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TXNRD3Q86VQ6 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TXNRD3Q86VQ6 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TXNRD3Q86VQ6 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TXNRD3Q86VQ6 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TXNRD3Q86VQ6 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TXNRD3Q86VQ6 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TXNRD3Q86VQ6 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TXNRD3Q86VQ6 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TXNRD3Q86VQ6 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TXNRD3Q86VQ6 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TXNRD3Q86VQ6 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TXNRD3Q86VQ6 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TXNRD3Q86VQ6 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TXNRD3Q86VQ6 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TXNRD3Q86VQ6 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TXNRD3Q86VQ6 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TXNRD3Q86VQ6 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TXNRD3Q86VQ6 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TXNRD3Q86VQ6 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TXNRD3Q86VQ6 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
TXNRD3Q86VQ6 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TXNRD3Q86VQ6 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TXNRD3Q86VQ6 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TXNRD3Q86VQ6 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TXNRD3Q86VQ6 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TXNRD3Q86VQ6 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
TXNRD3Q86VQ6 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TXNRD3Q86VQ6 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TXNRD3Q86VQ6 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms