Protein–RNA interactions for Protein: Q86VQ3

TXNDC2, Thioredoxin domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TXNDC2Q86VQ3 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
TXNDC2Q86VQ3 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
TXNDC2Q86VQ3 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
TXNDC2Q86VQ3 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
TXNDC2Q86VQ3 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
TXNDC2Q86VQ3 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
TXNDC2Q86VQ3 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
TXNDC2Q86VQ3 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
TXNDC2Q86VQ3 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
TXNDC2Q86VQ3 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
TXNDC2Q86VQ3 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.96
TXNDC2Q86VQ3 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC27.33■■□□□ 1.96
TXNDC2Q86VQ3 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TXNDC2Q86VQ3 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TXNDC2Q86VQ3 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
TXNDC2Q86VQ3 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TXNDC2Q86VQ3 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TXNDC2Q86VQ3 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
TXNDC2Q86VQ3 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
TXNDC2Q86VQ3 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
TXNDC2Q86VQ3 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC27.32■■□□□ 1.96
TXNDC2Q86VQ3 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
TXNDC2Q86VQ3 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
TXNDC2Q86VQ3 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TXNDC2Q86VQ3 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TXNDC2Q86VQ3 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TXNDC2Q86VQ3 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
TXNDC2Q86VQ3 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
TXNDC2Q86VQ3 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
TXNDC2Q86VQ3 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TXNDC2Q86VQ3 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
TXNDC2Q86VQ3 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TXNDC2Q86VQ3 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TXNDC2Q86VQ3 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TXNDC2Q86VQ3 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC27.31■■□□□ 1.96
TXNDC2Q86VQ3 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TXNDC2Q86VQ3 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
TXNDC2Q86VQ3 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TXNDC2Q86VQ3 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TXNDC2Q86VQ3 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TXNDC2Q86VQ3 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TXNDC2Q86VQ3 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
TXNDC2Q86VQ3 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TXNDC2Q86VQ3 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
TXNDC2Q86VQ3 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
TXNDC2Q86VQ3 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TXNDC2Q86VQ3 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TXNDC2Q86VQ3 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
TXNDC2Q86VQ3 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TXNDC2Q86VQ3 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
TXNDC2Q86VQ3 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TXNDC2Q86VQ3 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TXNDC2Q86VQ3 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
TXNDC2Q86VQ3 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
TXNDC2Q86VQ3 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
TXNDC2Q86VQ3 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
TXNDC2Q86VQ3 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TXNDC2Q86VQ3 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
TXNDC2Q86VQ3 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
TXNDC2Q86VQ3 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
TXNDC2Q86VQ3 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TXNDC2Q86VQ3 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TXNDC2Q86VQ3 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TXNDC2Q86VQ3 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
TXNDC2Q86VQ3 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
TXNDC2Q86VQ3 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
TXNDC2Q86VQ3 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
TXNDC2Q86VQ3 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
TXNDC2Q86VQ3 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
TXNDC2Q86VQ3 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
TXNDC2Q86VQ3 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
TXNDC2Q86VQ3 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
TXNDC2Q86VQ3 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
TXNDC2Q86VQ3 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
TXNDC2Q86VQ3 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
TXNDC2Q86VQ3 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
TXNDC2Q86VQ3 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
TXNDC2Q86VQ3 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
TXNDC2Q86VQ3 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
TXNDC2Q86VQ3 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
TXNDC2Q86VQ3 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
TXNDC2Q86VQ3 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
TXNDC2Q86VQ3 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TXNDC2Q86VQ3 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TXNDC2Q86VQ3 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
TXNDC2Q86VQ3 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TXNDC2Q86VQ3 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
TXNDC2Q86VQ3 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
TXNDC2Q86VQ3 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
TXNDC2Q86VQ3 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TXNDC2Q86VQ3 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
TXNDC2Q86VQ3 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
TXNDC2Q86VQ3 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC27.28■■□□□ 1.96
TXNDC2Q86VQ3 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TXNDC2Q86VQ3 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
TXNDC2Q86VQ3 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
TXNDC2Q86VQ3 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TXNDC2Q86VQ3 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
TXNDC2Q86VQ3 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TXNDC2Q86VQ3 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms