Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3J3

RGPD4, RanBP2-like and GRIP domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,758 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD4Q7Z3J3 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RGPD4Q7Z3J3 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RGPD4Q7Z3J3 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
RGPD4Q7Z3J3 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RGPD4Q7Z3J3 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RGPD4Q7Z3J3 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RGPD4Q7Z3J3 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RGPD4Q7Z3J3 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
RGPD4Q7Z3J3 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RGPD4Q7Z3J3 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RGPD4Q7Z3J3 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RGPD4Q7Z3J3 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RGPD4Q7Z3J3 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RGPD4Q7Z3J3 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RGPD4Q7Z3J3 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RGPD4Q7Z3J3 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RGPD4Q7Z3J3 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RGPD4Q7Z3J3 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RGPD4Q7Z3J3 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RGPD4Q7Z3J3 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RGPD4Q7Z3J3 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RGPD4Q7Z3J3 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RGPD4Q7Z3J3 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RGPD4Q7Z3J3 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RGPD4Q7Z3J3 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RGPD4Q7Z3J3 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RGPD4Q7Z3J3 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RGPD4Q7Z3J3 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RGPD4Q7Z3J3 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RGPD4Q7Z3J3 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
RGPD4Q7Z3J3 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RGPD4Q7Z3J3 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RGPD4Q7Z3J3 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RGPD4Q7Z3J3 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RGPD4Q7Z3J3 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RGPD4Q7Z3J3 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RGPD4Q7Z3J3 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RGPD4Q7Z3J3 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RGPD4Q7Z3J3 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RGPD4Q7Z3J3 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
RGPD4Q7Z3J3 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RGPD4Q7Z3J3 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RGPD4Q7Z3J3 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RGPD4Q7Z3J3 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
RGPD4Q7Z3J3 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RGPD4Q7Z3J3 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
RGPD4Q7Z3J3 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RGPD4Q7Z3J3 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RGPD4Q7Z3J3 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RGPD4Q7Z3J3 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RGPD4Q7Z3J3 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
RGPD4Q7Z3J3 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RGPD4Q7Z3J3 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RGPD4Q7Z3J3 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RGPD4Q7Z3J3 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RGPD4Q7Z3J3 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RGPD4Q7Z3J3 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RGPD4Q7Z3J3 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RGPD4Q7Z3J3 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RGPD4Q7Z3J3 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
RGPD4Q7Z3J3 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RGPD4Q7Z3J3 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RGPD4Q7Z3J3 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RGPD4Q7Z3J3 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RGPD4Q7Z3J3 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
RGPD4Q7Z3J3 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RGPD4Q7Z3J3 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RGPD4Q7Z3J3 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RGPD4Q7Z3J3 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RGPD4Q7Z3J3 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RGPD4Q7Z3J3 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RGPD4Q7Z3J3 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RGPD4Q7Z3J3 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RGPD4Q7Z3J3 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RGPD4Q7Z3J3 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RGPD4Q7Z3J3 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RGPD4Q7Z3J3 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RGPD4Q7Z3J3 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RGPD4Q7Z3J3 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RGPD4Q7Z3J3 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RGPD4Q7Z3J3 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
RGPD4Q7Z3J3 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RGPD4Q7Z3J3 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RGPD4Q7Z3J3 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RGPD4Q7Z3J3 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RGPD4Q7Z3J3 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
RGPD4Q7Z3J3 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.5
RGPD4Q7Z3J3 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
RGPD4Q7Z3J3 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
RGPD4Q7Z3J3 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
RGPD4Q7Z3J3 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.5
RGPD4Q7Z3J3 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
RGPD4Q7Z3J3 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
RGPD4Q7Z3J3 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
RGPD4Q7Z3J3 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
RGPD4Q7Z3J3 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RGPD4Q7Z3J3 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RGPD4Q7Z3J3 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RGPD4Q7Z3J3 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RGPD4Q7Z3J3 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.7 ms