Protein–RNA interactions for Protein: Q71RC1

PP13850, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q71RC1 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q71RC1 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q71RC1 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Q71RC1 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q71RC1 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Q71RC1 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q71RC1 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Q71RC1 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q71RC1 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q71RC1 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
Q71RC1 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Q71RC1 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Q71RC1 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
Q71RC1 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Q71RC1 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q71RC1 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Q71RC1 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q71RC1 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q71RC1 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q71RC1 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Q71RC1 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q71RC1 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q71RC1 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q71RC1 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q71RC1 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q71RC1 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q71RC1 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q71RC1 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q71RC1 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q71RC1 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q71RC1 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q71RC1 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q71RC1 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q71RC1 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q71RC1 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q71RC1 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q71RC1 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Q71RC1 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q71RC1 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Q71RC1 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Q71RC1 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q71RC1 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q71RC1 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q71RC1 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q71RC1 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q71RC1 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q71RC1 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q71RC1 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q71RC1 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q71RC1 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q71RC1 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q71RC1 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Q71RC1 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q71RC1 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q71RC1 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q71RC1 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q71RC1 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q71RC1 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q71RC1 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q71RC1 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q71RC1 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q71RC1 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q71RC1 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q71RC1 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q71RC1 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q71RC1 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q71RC1 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q71RC1 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q71RC1 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Q71RC1 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q71RC1 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Q71RC1 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q71RC1 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Q71RC1 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q71RC1 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q71RC1 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q71RC1 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q71RC1 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q71RC1 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q71RC1 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q71RC1 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q71RC1 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q71RC1 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q71RC1 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q71RC1 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q71RC1 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q71RC1 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q71RC1 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q71RC1 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q71RC1 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q71RC1 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q71RC1 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q71RC1 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q71RC1 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q71RC1 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q71RC1 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q71RC1 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q71RC1 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q71RC1 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q71RC1 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.2 ms