Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZW61

BBS12, Bardet-Biedl syndrome 12 protein, humanhuman

Predictions only

Length 710 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBS12Q6ZW61 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
BBS12Q6ZW61 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
BBS12Q6ZW61 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
BBS12Q6ZW61 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
BBS12Q6ZW61 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
BBS12Q6ZW61 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
BBS12Q6ZW61 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
BBS12Q6ZW61 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
BBS12Q6ZW61 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
BBS12Q6ZW61 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
BBS12Q6ZW61 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
BBS12Q6ZW61 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
BBS12Q6ZW61 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
BBS12Q6ZW61 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
BBS12Q6ZW61 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
BBS12Q6ZW61 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
BBS12Q6ZW61 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
BBS12Q6ZW61 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
BBS12Q6ZW61 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
BBS12Q6ZW61 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
BBS12Q6ZW61 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
BBS12Q6ZW61 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
BBS12Q6ZW61 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
BBS12Q6ZW61 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
BBS12Q6ZW61 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
BBS12Q6ZW61 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
BBS12Q6ZW61 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
BBS12Q6ZW61 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
BBS12Q6ZW61 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
BBS12Q6ZW61 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
BBS12Q6ZW61 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
BBS12Q6ZW61 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
BBS12Q6ZW61 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
BBS12Q6ZW61 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
BBS12Q6ZW61 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
BBS12Q6ZW61 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
BBS12Q6ZW61 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
BBS12Q6ZW61 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
BBS12Q6ZW61 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
BBS12Q6ZW61 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
BBS12Q6ZW61 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
BBS12Q6ZW61 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
BBS12Q6ZW61 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
BBS12Q6ZW61 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
BBS12Q6ZW61 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
BBS12Q6ZW61 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
BBS12Q6ZW61 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
BBS12Q6ZW61 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
BBS12Q6ZW61 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
BBS12Q6ZW61 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
BBS12Q6ZW61 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
BBS12Q6ZW61 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
BBS12Q6ZW61 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
BBS12Q6ZW61 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
BBS12Q6ZW61 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
BBS12Q6ZW61 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
BBS12Q6ZW61 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
BBS12Q6ZW61 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
BBS12Q6ZW61 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
BBS12Q6ZW61 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
BBS12Q6ZW61 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
BBS12Q6ZW61 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
BBS12Q6ZW61 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
BBS12Q6ZW61 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
BBS12Q6ZW61 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
BBS12Q6ZW61 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
BBS12Q6ZW61 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
BBS12Q6ZW61 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
BBS12Q6ZW61 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
BBS12Q6ZW61 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
BBS12Q6ZW61 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
BBS12Q6ZW61 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
BBS12Q6ZW61 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
BBS12Q6ZW61 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
BBS12Q6ZW61 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
BBS12Q6ZW61 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC19.81■□□□□ 0.76
BBS12Q6ZW61 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
BBS12Q6ZW61 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
BBS12Q6ZW61 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
BBS12Q6ZW61 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
BBS12Q6ZW61 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
BBS12Q6ZW61 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
BBS12Q6ZW61 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
BBS12Q6ZW61 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
BBS12Q6ZW61 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
BBS12Q6ZW61 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
BBS12Q6ZW61 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
BBS12Q6ZW61 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
BBS12Q6ZW61 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
BBS12Q6ZW61 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
BBS12Q6ZW61 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
BBS12Q6ZW61 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
BBS12Q6ZW61 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
BBS12Q6ZW61 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
BBS12Q6ZW61 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
BBS12Q6ZW61 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
BBS12Q6ZW61 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
BBS12Q6ZW61 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
BBS12Q6ZW61 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
BBS12Q6ZW61 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms