Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZW49

PAXIP1, PAX-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,069 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAXIP1Q6ZW49 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PAXIP1Q6ZW49 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PAXIP1Q6ZW49 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PAXIP1Q6ZW49 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PAXIP1Q6ZW49 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PAXIP1Q6ZW49 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PAXIP1Q6ZW49 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PAXIP1Q6ZW49 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PAXIP1Q6ZW49 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PAXIP1Q6ZW49 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PAXIP1Q6ZW49 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PAXIP1Q6ZW49 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PAXIP1Q6ZW49 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PAXIP1Q6ZW49 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PAXIP1Q6ZW49 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PAXIP1Q6ZW49 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PAXIP1Q6ZW49 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PAXIP1Q6ZW49 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PAXIP1Q6ZW49 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PAXIP1Q6ZW49 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PAXIP1Q6ZW49 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
PAXIP1Q6ZW49 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PAXIP1Q6ZW49 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
PAXIP1Q6ZW49 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
PAXIP1Q6ZW49 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
PAXIP1Q6ZW49 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PAXIP1Q6ZW49 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PAXIP1Q6ZW49 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PAXIP1Q6ZW49 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PAXIP1Q6ZW49 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PAXIP1Q6ZW49 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PAXIP1Q6ZW49 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PAXIP1Q6ZW49 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PAXIP1Q6ZW49 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PAXIP1Q6ZW49 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
PAXIP1Q6ZW49 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PAXIP1Q6ZW49 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PAXIP1Q6ZW49 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PAXIP1Q6ZW49 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PAXIP1Q6ZW49 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PAXIP1Q6ZW49 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PAXIP1Q6ZW49 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PAXIP1Q6ZW49 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PAXIP1Q6ZW49 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PAXIP1Q6ZW49 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
PAXIP1Q6ZW49 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PAXIP1Q6ZW49 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PAXIP1Q6ZW49 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
PAXIP1Q6ZW49 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PAXIP1Q6ZW49 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PAXIP1Q6ZW49 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PAXIP1Q6ZW49 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PAXIP1Q6ZW49 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
PAXIP1Q6ZW49 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PAXIP1Q6ZW49 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PAXIP1Q6ZW49 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PAXIP1Q6ZW49 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PAXIP1Q6ZW49 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PAXIP1Q6ZW49 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PAXIP1Q6ZW49 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PAXIP1Q6ZW49 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
PAXIP1Q6ZW49 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PAXIP1Q6ZW49 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
PAXIP1Q6ZW49 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PAXIP1Q6ZW49 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
PAXIP1Q6ZW49 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PAXIP1Q6ZW49 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PAXIP1Q6ZW49 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PAXIP1Q6ZW49 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PAXIP1Q6ZW49 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PAXIP1Q6ZW49 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PAXIP1Q6ZW49 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PAXIP1Q6ZW49 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PAXIP1Q6ZW49 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PAXIP1Q6ZW49 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PAXIP1Q6ZW49 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PAXIP1Q6ZW49 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PAXIP1Q6ZW49 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PAXIP1Q6ZW49 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PAXIP1Q6ZW49 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PAXIP1Q6ZW49 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PAXIP1Q6ZW49 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PAXIP1Q6ZW49 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PAXIP1Q6ZW49 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PAXIP1Q6ZW49 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PAXIP1Q6ZW49 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
PAXIP1Q6ZW49 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PAXIP1Q6ZW49 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PAXIP1Q6ZW49 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PAXIP1Q6ZW49 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PAXIP1Q6ZW49 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
PAXIP1Q6ZW49 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PAXIP1Q6ZW49 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PAXIP1Q6ZW49 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PAXIP1Q6ZW49 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PAXIP1Q6ZW49 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PAXIP1Q6ZW49 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PAXIP1Q6ZW49 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PAXIP1Q6ZW49 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PAXIP1Q6ZW49 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms