Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZW31

SYDE1, Rho GTPase-activating protein SYDE1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 735 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYDE1Q6ZW31 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
SYDE1Q6ZW31 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SYDE1Q6ZW31 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SYDE1Q6ZW31 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
SYDE1Q6ZW31 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SYDE1Q6ZW31 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.75
SYDE1Q6ZW31 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
SYDE1Q6ZW31 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
SYDE1Q6ZW31 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SYDE1Q6ZW31 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SYDE1Q6ZW31 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SYDE1Q6ZW31 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SYDE1Q6ZW31 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SYDE1Q6ZW31 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SYDE1Q6ZW31 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SYDE1Q6ZW31 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SYDE1Q6ZW31 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SYDE1Q6ZW31 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SYDE1Q6ZW31 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SYDE1Q6ZW31 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
SYDE1Q6ZW31 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SYDE1Q6ZW31 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SYDE1Q6ZW31 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SYDE1Q6ZW31 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SYDE1Q6ZW31 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SYDE1Q6ZW31 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SYDE1Q6ZW31 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SYDE1Q6ZW31 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
SYDE1Q6ZW31 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SYDE1Q6ZW31 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
SYDE1Q6ZW31 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SYDE1Q6ZW31 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SYDE1Q6ZW31 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SYDE1Q6ZW31 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SYDE1Q6ZW31 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SYDE1Q6ZW31 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SYDE1Q6ZW31 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SYDE1Q6ZW31 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SYDE1Q6ZW31 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SYDE1Q6ZW31 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SYDE1Q6ZW31 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SYDE1Q6ZW31 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SYDE1Q6ZW31 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SYDE1Q6ZW31 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SYDE1Q6ZW31 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SYDE1Q6ZW31 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
SYDE1Q6ZW31 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SYDE1Q6ZW31 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SYDE1Q6ZW31 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SYDE1Q6ZW31 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SYDE1Q6ZW31 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SYDE1Q6ZW31 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SYDE1Q6ZW31 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SYDE1Q6ZW31 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SYDE1Q6ZW31 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SYDE1Q6ZW31 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SYDE1Q6ZW31 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SYDE1Q6ZW31 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SYDE1Q6ZW31 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SYDE1Q6ZW31 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SYDE1Q6ZW31 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SYDE1Q6ZW31 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SYDE1Q6ZW31 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
SYDE1Q6ZW31 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SYDE1Q6ZW31 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SYDE1Q6ZW31 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SYDE1Q6ZW31 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SYDE1Q6ZW31 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SYDE1Q6ZW31 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SYDE1Q6ZW31 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SYDE1Q6ZW31 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SYDE1Q6ZW31 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SYDE1Q6ZW31 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SYDE1Q6ZW31 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SYDE1Q6ZW31 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SYDE1Q6ZW31 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SYDE1Q6ZW31 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SYDE1Q6ZW31 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SYDE1Q6ZW31 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SYDE1Q6ZW31 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SYDE1Q6ZW31 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SYDE1Q6ZW31 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SYDE1Q6ZW31 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SYDE1Q6ZW31 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SYDE1Q6ZW31 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SYDE1Q6ZW31 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SYDE1Q6ZW31 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SYDE1Q6ZW31 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SYDE1Q6ZW31 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SYDE1Q6ZW31 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SYDE1Q6ZW31 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SYDE1Q6ZW31 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
SYDE1Q6ZW31 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
SYDE1Q6ZW31 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
SYDE1Q6ZW31 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SYDE1Q6ZW31 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SYDE1Q6ZW31 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SYDE1Q6ZW31 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SYDE1Q6ZW31 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SYDE1Q6ZW31 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.3 ms