Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZVK1

TMEM179, Transmembrane protein 179, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM179Q6ZVK1 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMEM179Q6ZVK1 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMEM179Q6ZVK1 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMEM179Q6ZVK1 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMEM179Q6ZVK1 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
TMEM179Q6ZVK1 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMEM179Q6ZVK1 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMEM179Q6ZVK1 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMEM179Q6ZVK1 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
TMEM179Q6ZVK1 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMEM179Q6ZVK1 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMEM179Q6ZVK1 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMEM179Q6ZVK1 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMEM179Q6ZVK1 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMEM179Q6ZVK1 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
TMEM179Q6ZVK1 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMEM179Q6ZVK1 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMEM179Q6ZVK1 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMEM179Q6ZVK1 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMEM179Q6ZVK1 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMEM179Q6ZVK1 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMEM179Q6ZVK1 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TMEM179Q6ZVK1 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TMEM179Q6ZVK1 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TMEM179Q6ZVK1 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TMEM179Q6ZVK1 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TMEM179Q6ZVK1 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TMEM179Q6ZVK1 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TMEM179Q6ZVK1 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TMEM179Q6ZVK1 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TMEM179Q6ZVK1 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
TMEM179Q6ZVK1 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TMEM179Q6ZVK1 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TMEM179Q6ZVK1 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TMEM179Q6ZVK1 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TMEM179Q6ZVK1 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TMEM179Q6ZVK1 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TMEM179Q6ZVK1 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TMEM179Q6ZVK1 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TMEM179Q6ZVK1 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TMEM179Q6ZVK1 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMEM179Q6ZVK1 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMEM179Q6ZVK1 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMEM179Q6ZVK1 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMEM179Q6ZVK1 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMEM179Q6ZVK1 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMEM179Q6ZVK1 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMEM179Q6ZVK1 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMEM179Q6ZVK1 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMEM179Q6ZVK1 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMEM179Q6ZVK1 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMEM179Q6ZVK1 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMEM179Q6ZVK1 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMEM179Q6ZVK1 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMEM179Q6ZVK1 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMEM179Q6ZVK1 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMEM179Q6ZVK1 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMEM179Q6ZVK1 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMEM179Q6ZVK1 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMEM179Q6ZVK1 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMEM179Q6ZVK1 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMEM179Q6ZVK1 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMEM179Q6ZVK1 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMEM179Q6ZVK1 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMEM179Q6ZVK1 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMEM179Q6ZVK1 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMEM179Q6ZVK1 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMEM179Q6ZVK1 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMEM179Q6ZVK1 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMEM179Q6ZVK1 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMEM179Q6ZVK1 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMEM179Q6ZVK1 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
TMEM179Q6ZVK1 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMEM179Q6ZVK1 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMEM179Q6ZVK1 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMEM179Q6ZVK1 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMEM179Q6ZVK1 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMEM179Q6ZVK1 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMEM179Q6ZVK1 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMEM179Q6ZVK1 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMEM179Q6ZVK1 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMEM179Q6ZVK1 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMEM179Q6ZVK1 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMEM179Q6ZVK1 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
TMEM179Q6ZVK1 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMEM179Q6ZVK1 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMEM179Q6ZVK1 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
TMEM179Q6ZVK1 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMEM179Q6ZVK1 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMEM179Q6ZVK1 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMEM179Q6ZVK1 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMEM179Q6ZVK1 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMEM179Q6ZVK1 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMEM179Q6ZVK1 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMEM179Q6ZVK1 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMEM179Q6ZVK1 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMEM179Q6ZVK1 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMEM179Q6ZVK1 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMEM179Q6ZVK1 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMEM179Q6ZVK1 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms