Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZNB6

NFXL1, NF-X1-type zinc finger protein NFXL1, humanhuman

Predictions only

Length 911 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFXL1Q6ZNB6 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NFXL1Q6ZNB6 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NFXL1Q6ZNB6 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NFXL1Q6ZNB6 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NFXL1Q6ZNB6 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NFXL1Q6ZNB6 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NFXL1Q6ZNB6 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NFXL1Q6ZNB6 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NFXL1Q6ZNB6 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
NFXL1Q6ZNB6 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NFXL1Q6ZNB6 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NFXL1Q6ZNB6 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NFXL1Q6ZNB6 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NFXL1Q6ZNB6 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NFXL1Q6ZNB6 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NFXL1Q6ZNB6 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NFXL1Q6ZNB6 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
NFXL1Q6ZNB6 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
NFXL1Q6ZNB6 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NFXL1Q6ZNB6 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NFXL1Q6ZNB6 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
NFXL1Q6ZNB6 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NFXL1Q6ZNB6 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NFXL1Q6ZNB6 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NFXL1Q6ZNB6 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NFXL1Q6ZNB6 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NFXL1Q6ZNB6 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NFXL1Q6ZNB6 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NFXL1Q6ZNB6 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NFXL1Q6ZNB6 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NFXL1Q6ZNB6 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NFXL1Q6ZNB6 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NFXL1Q6ZNB6 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NFXL1Q6ZNB6 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NFXL1Q6ZNB6 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NFXL1Q6ZNB6 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NFXL1Q6ZNB6 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NFXL1Q6ZNB6 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NFXL1Q6ZNB6 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NFXL1Q6ZNB6 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NFXL1Q6ZNB6 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NFXL1Q6ZNB6 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NFXL1Q6ZNB6 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NFXL1Q6ZNB6 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NFXL1Q6ZNB6 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NFXL1Q6ZNB6 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NFXL1Q6ZNB6 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NFXL1Q6ZNB6 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NFXL1Q6ZNB6 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NFXL1Q6ZNB6 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NFXL1Q6ZNB6 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NFXL1Q6ZNB6 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NFXL1Q6ZNB6 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NFXL1Q6ZNB6 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NFXL1Q6ZNB6 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NFXL1Q6ZNB6 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NFXL1Q6ZNB6 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NFXL1Q6ZNB6 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
NFXL1Q6ZNB6 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NFXL1Q6ZNB6 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NFXL1Q6ZNB6 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NFXL1Q6ZNB6 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NFXL1Q6ZNB6 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
NFXL1Q6ZNB6 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NFXL1Q6ZNB6 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NFXL1Q6ZNB6 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NFXL1Q6ZNB6 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NFXL1Q6ZNB6 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NFXL1Q6ZNB6 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NFXL1Q6ZNB6 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NFXL1Q6ZNB6 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NFXL1Q6ZNB6 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NFXL1Q6ZNB6 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NFXL1Q6ZNB6 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NFXL1Q6ZNB6 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NFXL1Q6ZNB6 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NFXL1Q6ZNB6 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NFXL1Q6ZNB6 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NFXL1Q6ZNB6 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NFXL1Q6ZNB6 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
NFXL1Q6ZNB6 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NFXL1Q6ZNB6 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
NFXL1Q6ZNB6 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
NFXL1Q6ZNB6 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NFXL1Q6ZNB6 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NFXL1Q6ZNB6 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NFXL1Q6ZNB6 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NFXL1Q6ZNB6 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NFXL1Q6ZNB6 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NFXL1Q6ZNB6 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NFXL1Q6ZNB6 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NFXL1Q6ZNB6 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NFXL1Q6ZNB6 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NFXL1Q6ZNB6 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NFXL1Q6ZNB6 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NFXL1Q6ZNB6 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NFXL1Q6ZNB6 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NFXL1Q6ZNB6 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NFXL1Q6ZNB6 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NFXL1Q6ZNB6 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms