Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMN7

PDZRN4, PDZ domain-containing RING finger protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,036 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDZRN4Q6ZMN7 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDZRN4Q6ZMN7 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDZRN4Q6ZMN7 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDZRN4Q6ZMN7 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDZRN4Q6ZMN7 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PDZRN4Q6ZMN7 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PDZRN4Q6ZMN7 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PDZRN4Q6ZMN7 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PDZRN4Q6ZMN7 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PDZRN4Q6ZMN7 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PDZRN4Q6ZMN7 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PDZRN4Q6ZMN7 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PDZRN4Q6ZMN7 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PDZRN4Q6ZMN7 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PDZRN4Q6ZMN7 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PDZRN4Q6ZMN7 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PDZRN4Q6ZMN7 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PDZRN4Q6ZMN7 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PDZRN4Q6ZMN7 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PDZRN4Q6ZMN7 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PDZRN4Q6ZMN7 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PDZRN4Q6ZMN7 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PDZRN4Q6ZMN7 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PDZRN4Q6ZMN7 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PDZRN4Q6ZMN7 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PDZRN4Q6ZMN7 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PDZRN4Q6ZMN7 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PDZRN4Q6ZMN7 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PDZRN4Q6ZMN7 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PDZRN4Q6ZMN7 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PDZRN4Q6ZMN7 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PDZRN4Q6ZMN7 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PDZRN4Q6ZMN7 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PDZRN4Q6ZMN7 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
PDZRN4Q6ZMN7 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
PDZRN4Q6ZMN7 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
PDZRN4Q6ZMN7 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
PDZRN4Q6ZMN7 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PDZRN4Q6ZMN7 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PDZRN4Q6ZMN7 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PDZRN4Q6ZMN7 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PDZRN4Q6ZMN7 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PDZRN4Q6ZMN7 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PDZRN4Q6ZMN7 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PDZRN4Q6ZMN7 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PDZRN4Q6ZMN7 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PDZRN4Q6ZMN7 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PDZRN4Q6ZMN7 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PDZRN4Q6ZMN7 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PDZRN4Q6ZMN7 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PDZRN4Q6ZMN7 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PDZRN4Q6ZMN7 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
PDZRN4Q6ZMN7 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PDZRN4Q6ZMN7 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
PDZRN4Q6ZMN7 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PDZRN4Q6ZMN7 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PDZRN4Q6ZMN7 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PDZRN4Q6ZMN7 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PDZRN4Q6ZMN7 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PDZRN4Q6ZMN7 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PDZRN4Q6ZMN7 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PDZRN4Q6ZMN7 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PDZRN4Q6ZMN7 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PDZRN4Q6ZMN7 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PDZRN4Q6ZMN7 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PDZRN4Q6ZMN7 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PDZRN4Q6ZMN7 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PDZRN4Q6ZMN7 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PDZRN4Q6ZMN7 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PDZRN4Q6ZMN7 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PDZRN4Q6ZMN7 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC22■■□□□ 1.11
PDZRN4Q6ZMN7 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PDZRN4Q6ZMN7 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PDZRN4Q6ZMN7 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PDZRN4Q6ZMN7 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PDZRN4Q6ZMN7 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC22■■□□□ 1.11
PDZRN4Q6ZMN7 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
PDZRN4Q6ZMN7 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PDZRN4Q6ZMN7 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PDZRN4Q6ZMN7 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PDZRN4Q6ZMN7 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PDZRN4Q6ZMN7 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PDZRN4Q6ZMN7 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PDZRN4Q6ZMN7 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PDZRN4Q6ZMN7 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PDZRN4Q6ZMN7 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
PDZRN4Q6ZMN7 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PDZRN4Q6ZMN7 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PDZRN4Q6ZMN7 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PDZRN4Q6ZMN7 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PDZRN4Q6ZMN7 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PDZRN4Q6ZMN7 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PDZRN4Q6ZMN7 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PDZRN4Q6ZMN7 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PDZRN4Q6ZMN7 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PDZRN4Q6ZMN7 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PDZRN4Q6ZMN7 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PDZRN4Q6ZMN7 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PDZRN4Q6ZMN7 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PDZRN4Q6ZMN7 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms