Protein–RNA interactions for Protein: Q6PF15

KLHL35, Kelch-like protein 35, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL35Q6PF15 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
KLHL35Q6PF15 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
KLHL35Q6PF15 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
KLHL35Q6PF15 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
KLHL35Q6PF15 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
KLHL35Q6PF15 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
KLHL35Q6PF15 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
KLHL35Q6PF15 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
KLHL35Q6PF15 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
KLHL35Q6PF15 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
KLHL35Q6PF15 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
KLHL35Q6PF15 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
KLHL35Q6PF15 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
KLHL35Q6PF15 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
KLHL35Q6PF15 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
KLHL35Q6PF15 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
KLHL35Q6PF15 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
KLHL35Q6PF15 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
KLHL35Q6PF15 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
KLHL35Q6PF15 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
KLHL35Q6PF15 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
KLHL35Q6PF15 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
KLHL35Q6PF15 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
KLHL35Q6PF15 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
KLHL35Q6PF15 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
KLHL35Q6PF15 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
KLHL35Q6PF15 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
KLHL35Q6PF15 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
KLHL35Q6PF15 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
KLHL35Q6PF15 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
KLHL35Q6PF15 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
KLHL35Q6PF15 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
KLHL35Q6PF15 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
KLHL35Q6PF15 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
KLHL35Q6PF15 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
KLHL35Q6PF15 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
KLHL35Q6PF15 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
KLHL35Q6PF15 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
KLHL35Q6PF15 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
KLHL35Q6PF15 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
KLHL35Q6PF15 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
KLHL35Q6PF15 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
KLHL35Q6PF15 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
KLHL35Q6PF15 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
KLHL35Q6PF15 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.94■□□□□ 0.62
KLHL35Q6PF15 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
KLHL35Q6PF15 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
KLHL35Q6PF15 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
KLHL35Q6PF15 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
KLHL35Q6PF15 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
KLHL35Q6PF15 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
KLHL35Q6PF15 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
KLHL35Q6PF15 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
KLHL35Q6PF15 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
KLHL35Q6PF15 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
KLHL35Q6PF15 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
KLHL35Q6PF15 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
KLHL35Q6PF15 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
KLHL35Q6PF15 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
KLHL35Q6PF15 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
KLHL35Q6PF15 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
KLHL35Q6PF15 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
KLHL35Q6PF15 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
KLHL35Q6PF15 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
KLHL35Q6PF15 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
KLHL35Q6PF15 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
KLHL35Q6PF15 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
KLHL35Q6PF15 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
KLHL35Q6PF15 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
KLHL35Q6PF15 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
KLHL35Q6PF15 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
KLHL35Q6PF15 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
KLHL35Q6PF15 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
KLHL35Q6PF15 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
KLHL35Q6PF15 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
KLHL35Q6PF15 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
KLHL35Q6PF15 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
KLHL35Q6PF15 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
KLHL35Q6PF15 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
KLHL35Q6PF15 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
KLHL35Q6PF15 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
KLHL35Q6PF15 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
KLHL35Q6PF15 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
KLHL35Q6PF15 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
KLHL35Q6PF15 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
KLHL35Q6PF15 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
KLHL35Q6PF15 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
KLHL35Q6PF15 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
KLHL35Q6PF15 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
KLHL35Q6PF15 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
KLHL35Q6PF15 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
KLHL35Q6PF15 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
KLHL35Q6PF15 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
KLHL35Q6PF15 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
KLHL35Q6PF15 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
KLHL35Q6PF15 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
KLHL35Q6PF15 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
KLHL35Q6PF15 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
KLHL35Q6PF15 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
KLHL35Q6PF15 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms